RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518468.1

RB1CC1-205, Transcript of RB1 inducible coiled-coil 1, human

TSL 3

Gene RB1CC1, Length 507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RB1CC1-205	ENST00000518468	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	NINJ1	Q92982	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	WNT9A	O14904	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	SOD2	P04179	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	INSRR	P14616	1297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	TUSC3	Q13454	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	MAF1	Q9H063	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	KLHL18	O94889	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	GNAT1	P11488	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	COL6A2	P12110	1019 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	RAB27A	P51159	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	NEK2	P51955	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	PPP2CB	P62714	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	PPP2CA	P67775	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	DSE	Q9UL01	958 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RB1CC1-205	ENST00000518468	PLD2	O14939	933 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	KCNQ2	O43526	872 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	RFPL3	O75679	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	KNG1	P01042	644 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	APP	P05067	770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	CKM	P06732	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ZNF20	P17024	532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	CD53	P19397	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	GRIN1	Q05586	938 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	MCL1	Q07820	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	STRN3	Q13033	797 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	MLC1	Q15049	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	VPS72	Q15906	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	NME8	Q8N427	588 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ZNF536	O15090	1300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	BLACE	A4D250	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ACOT7	O00154	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	AQP7	O14520	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	LTF	P02788	710 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms