RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM90A27PA6NNH2 459 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 RHOBTB3O94955 611 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTGS2P35354 604 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 ECE1P42892 770 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 MRE11P49959 708 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 ST5P78524 1137 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 CRHR2Q13324 411 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 CRY1Q16526 586 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 FNDC7Q5VTL7 733 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 KANK2Q63ZY3 851 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 GRAMD4Q6IC98 578 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTPRN2Q92932 1015 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 CATSPERZQ9NTU4 200 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 BTBD7Q9P203 1132 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 DMRT1Q9Y5R6 373 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRAMEF25A6NGN4 478 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 ARVCFO00192 962 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRAF5O00463 557 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAN2B1O00754 1011 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 TBR1Q16650 682 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCSK4Q6UW60 755 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 SCUBE1Q8IWY4 988 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPR135Q8IZ08 494 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 RABGGTAQ92696 567 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 CLIP3Q96DZ5 547 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 ASB1Q9Y576 335 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADCY8P40145 1251 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 GABREP78334 506 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 RIN1Q13671 783 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 MOGSQ13724 837 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANKS3Q6ZW76 656 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC43A3Q8NBI5 491 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 MIEF2Q96C03 454 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 AGAP2Q99490 1192 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 WDR26Q9H7D7 661 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 A0A1W2PRX2 142 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 FOXN1O15353 648 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 KLF4O43474 513 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 MPIG6BO95866 241 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 AMY2AP04746 511 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDE6AP16499 860 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 AMY2BP19961 511 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 TGM1P22735 817 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 APEX1P27695 318 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 SDHAP31040 664 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAN2A2P49641 1150 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 LONRF2Q1L5Z9 754 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 GAGE13Q4V321 117 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 KLHDC10Q6PID8 442 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 MCF2L2Q86YR7 1114 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR14K1Q8NGZ2 314 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCDH19Q8TAB3 1148 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 E2F7Q96AV8 911 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 VOPP1Q96AW1 172 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 GMLQ99445 158 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC6A15Q9H2J7 730 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNH7Q9NS40 1196 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-397P-201ENST00000516226 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 CD83Q01151 205 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 GUCY1A3Q02108 690 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 MFSD5Q6N075 450 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 LENG9Q96B70 501 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDC6Q99741 560 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 TINF2Q9BSI4 451 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPATA9Q9BWV2 254 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 AMNQ9BXJ7 453 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 ST7Q9NRC1 585 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM184BQ9ULE4 1060 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 ASXL2Q76L83 1435 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCSK5Q92824 1860 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms