RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 KIF11P52732 1056 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 COG2Q14746 738 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 SPA17Q15506 151 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 PADI6Q6TGC4 694 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 HIP1RO75146 1068 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 ODR4Q5SWX8 454 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 DAW1Q8N136 415 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 CRACR2AQ9BSW2 395 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 GANQ9H2C0 597 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 TFR2Q9UP52 801 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 CYP27A1Q02318 531 aa25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 TSGA10Q9BZW7 698 aa25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 NLRC4Q9NPP4 1024 aa25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 SAMM50Q9Y512 469 aa25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 WDR90Q96KV7 1748 aa25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 CLIC2O15247 247 aa25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 CASP4P49662 377 aa25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 HGSNATQ68CP4 663 aa25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 STRA6Q9BX79 667 aa25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 CCND2P30279 289 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 RARRES1P49788 294 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 JAK3P52333 1124 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 SFMBT2Q5VUG0 894 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 BORCS6Q96GS4 357 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 DEF6Q9H4E7 631 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 PLCB1Q9NQ66 1216 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 MYPNQ86TC9 1320 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 PPP1R37O75864 691 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 AMPD2Q01433 879 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 KRT76Q01546 638 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 CEP112Q8N8E3 955 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 MKNK1Q9BUB5 465 aa25.1■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 MYH11P35749 1972 aa25.09■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 ATP9AO75110 1047 aa25.09■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 SFNP31947 248 aa25.09■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa25.09■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 SLC35C1Q96A29 364 aa25.09■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 GPRASP2Q96D09 838 aa25.09■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.09■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 MAF1Q9H063 256 aa25.09■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa25.09■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 SBF1O95248 1867 aa25.09■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.09■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 WDR64B1ANS9 1081 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 AKR1B10O60218 316 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 KIF5AQ12840 1032 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 HS2ST1Q7LGA3 356 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 C4orf19Q8IY42 314 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 GOLGA1Q92805 767 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 TLR2O60603 784 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 SERPING1P05155 500 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 NR3C2P08235 984 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 APBA1Q02410 837 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 RDM1Q8NG50 284 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 GBP3Q9H0R5 595 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 IKZF4Q9H2S9 585 aa25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 CCNE2O96020 404 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 UGCGQ16739 394 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 FAM186BQ8IYM0 893 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 DMAC2Q9NW81 257 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 PSMC5P62195 406 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-223ENST00000515011 ALCAMQ13740 583 aa25.07■■□□□ 1.6
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