RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 TCEAL1Q15170 157 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 DLK2Q6UY11 383 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 LILRB2Q8N423 598 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 COA1Q9GZY4 146 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 BRCA2P51587 3418 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 MED23Q9ULK4 1368 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 RAD50Q92878 1312 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 HMX2A2RU54 273 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 SNAP23O00161 211 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ENPP3O14638 875 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 LEFTY1O75610 366 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 IDH1O75874 414 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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HERC3-210ENST00000512194 MCAMP43121 646 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 KIR3DL1P43629 444 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 GSK3AP49840 483 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 GSTO1P78417 241 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 CYP27A1Q02318 531 aa8.64□□□□□ -1.03
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HERC3-210ENST00000512194 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 SPATC1Q76KD6 591 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 SGSM3Q96HU1 749 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 GBP3Q9H0R5 595 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 CD209Q9NNX6 404 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 HMG20BQ9P0W2 317 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 POLLQ9UGP5 575 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.64□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 SCN9AQ15858 1988 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 AGRPO00253 132 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 CBFA2T2O43439 604 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 CA12O43570 354 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 EPHX1P07099 455 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 CD247P20963 164 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 HSD3B2P26439 372 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.63□□□□□ -1.03
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HERC3-210ENST00000512194 C2orf27AQ580R0 203 aa8.63□□□□□ -1.03
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HERC3-210ENST00000512194 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.63□□□□□ -1.03
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HERC3-210ENST00000512194 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 PSMD1Q99460 953 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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HERC3-210ENST00000512194 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 PRR13Q9NZ81 148 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 RAI14Q9P0K7 980 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 WHRNQ9P202 907 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ABCF2Q9UG63 623 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 SHTN1A0MZ66 631 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 LDHCP07864 332 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 IL1R1P14778 569 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ADMP35318 185 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
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HERC3-210ENST00000512194 RNF43Q68DV7 783 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 CERS3Q8IU89 383 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 APPBP2Q92624 585 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 KCNH3Q9ULD8 1083 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 SALL1Q9NSC2 1324 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 LRRC37AA6NMS7 1700 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 SZT2Q5T011 3432 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 SHOXO15266 292 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 GSC2O15499 205 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 SGSM2O43147 1006 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 PPIP5K2O43314 1243 aa8.61□□□□□ -1.03
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