RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 STBD1O95210 358 aa28.77■■■□□ 2.2
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HOXB3-212ENST00000498678 NMT1P30419 496 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
HOXB3-212ENST00000498678 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
HOXB3-212ENST00000498678 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
HOXB3-212ENST00000498678 MAP7D2Q96T17 732 aa28.77■■■□□ 2.2
HOXB3-212ENST00000498678 MORF4L1Q9UBU8 362 aa28.77■■■□□ 2.2
HOXB3-212ENST00000498678 ATG7O95352 703 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 EDRF1Q3B7T1 1238 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 MIIPQ5JXC2 388 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 CEP135Q66GS9 1140 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 PLA2G4FQ68DD2 849 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 EEPD1Q7L9B9 569 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa28.76■■■□□ 2.19
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HOXB3-212ENST00000498678 ODR4Q5SWX8 454 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF720Q7Z2F6 126 aa28.75■■■□□ 2.19
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HOXB3-212ENST00000498678 CEP63Q96MT8 703 aa28.75■■■□□ 2.19
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HOXB3-212ENST00000498678 FAM178BQ8IXR5 827 aa28.74■■■□□ 2.19
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HOXB3-212ENST00000498678 SPTLC3Q9NUV7 552 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa28.74■■■□□ 2.19
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HOXB3-212ENST00000498678 WDR81Q562E7 1941 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 A0A1W2PQC6 194 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 PDXKO00764 312 aa28.73■■■□□ 2.19
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HOXB3-212ENST00000498678 PPFIBP1Q86W92 1011 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
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HOXB3-212ENST00000498678 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.192e-6■□□□□ 11
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HOXB3-212ENST00000498678 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
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HOXB3-212ENST00000498678 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa28.71■■■□□ 2.19
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HOXB3-212ENST00000498678 RASAL3Q86YV0 1011 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 CPLX3Q8WVH0 158 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 STRA6Q9BX79 667 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa28.7■■■□□ 2.19
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HOXB3-212ENST00000498678 VWA3BQ502W6 1294 aa28.7■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 TMEM139Q8IV31 216 aa28.7■■■□□ 2.19
HOXB3-212ENST00000498678 CEP170P1Q96L14 293 aa28.7■■■□□ 2.19
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HOXB3-212ENST00000498678 PLS3P13797 630 aa28.69■■■□□ 2.18
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HOXB3-212ENST00000498678 ZNF792Q3KQV3 632 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB3-212ENST00000498678 KCNV1Q6PIU1 500 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB3-212ENST00000498678 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF302Q9NR11 478 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB3-212ENST00000498678 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB3-212ENST00000498678 MYH11P35749 1972 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB3-212ENST00000498678 CETN3O15182 167 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB3-212ENST00000498678 PPP1R37O75864 691 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB3-212ENST00000498678 GGPS1O95749 300 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB3-212ENST00000498678 ADORA2AP29274 412 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB3-212ENST00000498678 CASP14P31944 242 aa28.69■■■□□ 2.18
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