RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495785.1

SRSF10-215, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 10, humanhuman

TSL 5

Gene SRSF10, Length 1,390 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF10-215ENST00000495785 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.6□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.6□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.6□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.6□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 MTMR7Q9Y216 660 aa8.6□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 TSPY2A6NKD2 308 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 GHRHP01286 108 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 ASGR1P07306 291 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 RAG1P15918 1043 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 RFX1P22670 979 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 SLC1A4P43007 532 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 CDK7P50613 346 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 OAZ1P54368 228 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 PDE1AP54750 535 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 BEX3Q00994 111 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 CCDC174Q6PII3 467 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 FAM133AQ8N9E0 248 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 NUP133Q8WUM0 1156 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 MYO19Q96H55 970 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 FAM227BQ96M60 508 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 TOX2Q96NM4 488 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 RNF146Q9NTX7 359 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 FBXO40Q9UH90 709 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 STX8Q9UNK0 236 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 CDH23Q9H251 3354 aa8.59□□□□□ -1.03
SRSF10-215ENST00000495785 ASTN1O14525 1302 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 PLA2G6O60733 806 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 TIMP1P01033 207 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 FGAP02671 866 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 FGRP09769 529 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 ALAS1P13196 640 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 SLC16A2P36021 539 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 NOVP48745 357 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 STAT2P52630 851 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 GJA9P57773 515 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 ALX1Q15699 326 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 LCE4AQ5TA78 99 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 ACAD11Q709F0 780 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 FAM160B2Q86V87 743 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 EVI5LQ96CN4 794 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 MUC3BQ9H195 1237 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 RBSNQ9H1K0 784 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 ACAD9Q9H845 621 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.58□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 ELP1O95163 1332 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 A0A0D9SFI3 127 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 ARVCFO00192 962 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 TNFAIP2Q03169 654 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 FPGSQ05932 587 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 TAPT1Q6NXT6 567 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 EEPD1Q7L9B9 569 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 MYLIPQ8WY64 445 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 62.1
SRSF10-215ENST00000495785 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 CYP39A1Q9NYL5 469 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 TBX21Q9UL17 535 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 PPME1Q9Y570 386 aa8.57□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 VCANP13611 3396 aa8.56□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 ASB14A6NK59 587 aa8.56□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 GRXCR1A8MXD5 290 aa8.56□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 ORC4O43929 436 aa8.56□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 WISP1O95388 367 aa8.56□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 ACRP10323 421 aa8.56□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 HAND2P61296 217 aa8.56□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 NKX3-2P78367 333 aa8.56□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SRSF10-215ENST00000495785 TKFCQ3LXA3 575 aa8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms