RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493767.1

DYSF-218, Transcript of dysferlin, humanhuman

TSL 3

Gene DYSF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSF-218ENST00000493767 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.36■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 LAMA3Q16787 3333 aa20.36■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 CHRNA1P02708 482 aa20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 SELPP16109 830 aa20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 PRPHP41219 470 aa20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 MGAT3Q09327 533 aa20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 BFSP2Q13515 415 aa20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 SHHQ15465 462 aa20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 MTERF2Q49AM1 385 aa20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 XKR3Q5GH77 459 aa20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 TPH2Q8IWU9 490 aa20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 C4orf19Q8IY42 314 aa20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 FAM167AQ96KS9 214 aa20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 GBF1Q92538 1859 aa20.35■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 TCHHQ07283 1943 aa20.34■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.34■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 F13A1P00488 732 aa20.34■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 DDIT3P35638 169 aa20.34■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 CLCN3P51790 818 aa20.34■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.34■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 POTEGQ6S5H5 508 aa20.34■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.34■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 RPAINQ86UA6 219 aa20.34■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.34■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.34■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 TMEM199Q8N511 208 aa20.34■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 LAD1O00515 517 aa20.33■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 LYPLA2O95372 231 aa20.33■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 FAM26DQ5JW98 314 aa20.33■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 TMEM240Q5SV17 173 aa20.33■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.33■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.33■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.33■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 IL23AQ9NPF7 189 aa20.33■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.33■□□□□ 0.85
DYSF-218ENST00000493767 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 BRD1O95696 1058 aa20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 ZNF365Q70YC5 407 aa20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 RETREG2Q8NC44 543 aa20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 LRRC15Q8TF66 581 aa20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.32■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 CXCL10P02778 98 aa20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 RSPH10BP0C881 870 aa20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 RPA1P27694 616 aa20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 BECN1Q14457 450 aa20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 PDIA5Q14554 519 aa20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 KCNK18Q7Z418 384 aa20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 NEK9Q8TD19 979 aa20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.31■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.3■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 VTNP04004 478 aa20.3■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.3■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 USP49Q70CQ1 688 aa20.3■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.3■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 PNMA5Q96PV4 448 aa20.3■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.3■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.3■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 CAND2O75155 1236 aa20.29■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 RARRES1P49788 294 aa20.29■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 RASIP1Q5U651 963 aa20.29■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 TDHQ8IZJ6 230 aa20.29■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 METTL13Q8N6R0 699 aa20.29■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.29■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 CEP170P1Q96L14 293 aa20.29■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 CLIC6Q96NY7 704 aa20.29■□□□□ 0.84
DYSF-218ENST00000493767 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms