RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487625.1

USP9X-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 9 X-linked, human

TSL 2

Gene USP9X, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP9X-208	ENST00000487625	ECI1	P42126	302 aa		4.24	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.24	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.24	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.24	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.24	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.24	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.24	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.24	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625		A0A1W2PQH9	124 aa		4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	SCG5	P05408	212 aa		4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	STAT3	P40763	770 aa		4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	MEOX1	P50221	254 aa		4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	SPON2	Q9BUD6	331 aa		4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	TRIM38	O00635	465 aa		4.22	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	TBX1	O43435	398 aa		4.22	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.22	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.22	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.22	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.22	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.22	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	MNT	Q99583	582 aa		4.22	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.22	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
USP9X-208	ENST00000487625	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	CBSL	P0DN79	551 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	CBS	P35520	551 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	USP14	P54578	494 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	EPHA5	P54756	1037 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	LPXN	O60711	386 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	NHLH1	Q02575	133 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	STIL	Q15468	1287 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	APBA2	Q99767	749 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.19	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	MATN4	O95460	622 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	COL6A2	P12110	1019 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	KRT10	P13645	584 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	HOXC12	P31275	282 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	STAT5B	P51692	787 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	ST5	P78524	1137 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	FOXI1	Q12951	378 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	ACAP1	Q15027	740 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625		Q9UFV3	132 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	PLA2G5	P39877	138 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	MSC	O60682	206 aa		4.16	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.16	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	CCKBR	P32239	447 aa		4.16	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	CXCR5	P32302	372 aa		4.16	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	SEC24C	P53992	1094 aa		4.16	□□□□□ -1.74
USP9X-208	ENST00000487625	CD83	Q01151	205 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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