RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479499.1

LAMC1-204, Transcript of laminin subunit gamma 1, human

TSL 3

Gene LAMC1, Length 700 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMC1-204	ENST00000479499	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	FAM86B1	E9PN63	330 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499		M0QZ92	97 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ATP4A	P20648	1035 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	NRIP1	P48552	1158 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	NDUFV1	P49821	464 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ADCY7	P51828	1080 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	NME8	Q8N427	588 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499		C9IYK1	514 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	CDC27	P30260	824 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	SLC26A2	P50443	739 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	COASY	Q13057	564 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	RTN1	Q16799	776 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ADAM2	Q99965	735 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	BARHL2	Q9NY43	387 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	BACH1	O14867	736 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	HBP1	O60381	514 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	C22orf31	O95567	290 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	MRE11	P49959	708 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ERVFC1	P60507	584 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	EDA	Q92838	391 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	PER2	O15055	1255 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ZBTB43	O43298	467 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	FGFR1	P11362	822 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	FAM189B	P81408	668 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	DSC3	Q14574	896 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	CWH43	Q9H720	699 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ZNF302	Q9NR11	478 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	COL1A2	P08123	1366 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	GPR32	O75388	356 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	FGF18	O76093	207 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	VTN	P04004	478 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	CYP3A4	P08684	503 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ZNF76	P36508	570 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LAMC1-204	ENST00000479499	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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