RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477982.2

FBXL3-205, Transcript of F-box and leucine rich repeat protein 3, human

TSL 2

Gene FBXL3, Length 3,172 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXL3-205	ENST00000477982	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	IFT43	Q96FT9	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	FCER1A	P12319	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	CD53	P19397	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	SUSD6	Q92537	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	KLF15	Q9UIH9	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	EML1	O00423	815 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	GOLIM4	O00461	696 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	NR1I2	O75469	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	PSMC4	P43686	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	SERINC5	Q86VE9	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	NCAN	O14594	1321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	TNFRSF21	O75509	655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	IL2RA	P01589	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	SDHB	P21912	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	GYG1	P46976	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	MSS51	Q4VC12	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982		B2RBV5	119 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	ENPP3	O14638	875 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	ZNF623	O75123	536 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	ACTN1	P12814	892 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	GRIK5	Q16478	980 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	NFIL3	Q16649	462 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXL3-205	ENST00000477982	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	LILRA1	O75019	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	TRPA1	O75762	1119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	S1PR4	O95977	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	TXLNA	P40222	546 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	MASP1	P48740	699 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FBXL3-205	ENST00000477982	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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