RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471572.6

NF1-208, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

TSL 2

Gene NF1, Length 2,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-208ENST00000471572 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 SHISA3A0PJX4 238 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 MYF5P13349 255 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 SEPHS1P49903 392 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 ZBED6P86452 979 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 APBA1Q02410 837 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 PMS2P11Q13670 270 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 SNX17Q15036 470 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 IFFO2Q5TF58 517 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 CPZQ66K79 652 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 GGT6Q6P531 493 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 DDX11Q96FC9 970 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 ANO3Q9BYT9 981 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.24□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 K7ENM7 598 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 MGEA5O60502 916 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 GFPT2O94808 682 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 BAIAP3O94812 1187 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 PAPLNO95428 1278 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 SEC23AQ15436 765 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 MSL1Q68DK7 614 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 FAAH2Q6GMR7 532 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 ZBTB10Q96DT7 871 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 JAM3Q9BX67 310 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 POM121BA6NF01 834 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 ADAMTS3O15072 1205 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 ANP32CO43423 234 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 WISP1O95388 367 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 TAF5Q15542 800 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 PITRM1Q5JRX3 1037 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 RNF152Q8N8N0 203 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa7.23□□□□□ -1.25
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NF1-208ENST00000471572 AREL1O15033 823 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 FGF18O76093 207 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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NF1-208ENST00000471572 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 SPECC1Q5M775 1068 aa7.22□□□□□ -1.25
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NF1-208ENST00000471572 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 ZNF527Q8NB42 609 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 PANK1Q8TE04 598 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 APIPQ96GX9 242 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 PIDD1Q9HB75 910 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 TBC1D22BQ9NU19 505 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 CCDC154A6NI56 674 aa7.22□□□□□ -1.25
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NF1-208ENST00000471572 GSNP06396 782 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 LPLP06858 475 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 ETV3P41162 512 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 TECP42680 631 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 PRKG2Q13237 762 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 DYMQ7RTS9 669 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 DAAM2Q86T65 1068 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 ASB12Q8WXK4 309 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 Q96M66 194 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 MAGEH1Q9H213 219 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.22□□□□□ -1.25
NF1-208ENST00000471572 F8W8V4 182 aa7.21□□□□□ -1.26
NF1-208ENST00000471572 MAN2B1O00754 1011 aa7.21□□□□□ -1.26
NF1-208ENST00000471572 CKMT1AP12532 417 aa7.21□□□□□ -1.26
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