RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 SHC4Q6S5L8 630 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CALML4Q96GE6 196 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CEP170P1Q96L14 293 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 TOX2Q96NM4 488 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 PNMA5Q96PV4 448 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 NACC1Q96RE7 527 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 PANK2Q9BZ23 570 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CYP26B1Q9NR63 512 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 TUBE1Q9UJT0 475 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 COL1A2P08123 1366 aa9.87□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 WDR81Q562E7 1941 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 E9PMD0 336 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 C22orf31O95567 290 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CLTBP09497 229 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 PLCG1P19174 1290 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 MUTP22033 750 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 ADAM17P78536 824 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 KCNK18Q7Z418 384 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 METTL13Q8N6R0 699 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 PDILTQ8N807 584 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 WNT8BQ93098 351 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 DNM3Q9UQ16 869 aa9.86□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 SLC26A4O43511 780 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 THPOP40225 353 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 RARRES1P49788 294 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 RGS19P49795 217 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CLCN3P51790 818 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 PTK7Q13308 1070 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 HYIQ5T013 277 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 RESP18Q5W5W9 173 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 SERINC5Q86VE9 423 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 LRRC15Q8TF66 581 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CEP89Q96ST8 783 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 TBX21Q9UL17 535 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 ALPK3Q96L96 1907 aa9.85□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 TCHHQ07283 1943 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 A0A087X0B3 334 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1B0GVL5 298 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 MAGEB2O15479 319 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 USO1O60763 962 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 MAFO75444 373 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 EYA4O95677 639 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CTSHP09668 335 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 PLA2G4BP0C869 781 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 SYN1P17600 705 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CMA1P23946 247 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 RFC5P40937 340 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 STAT6P42226 847 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 DRP2Q13474 957 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 EMC2Q15006 297 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 ADALQ6DHV7 355 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.84□□□□□ -0.83
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms