RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 XKR3Q5GH77 459 aa16.58■□□□□ 0.24
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SH3BP1-205ENST00000466097 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
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SH3BP1-205ENST00000466097 SMC3Q9UQE7 1217 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 TRPV2Q9Y5S1 764 aa16.58■□□□□ 0.24
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SH3BP1-205ENST00000466097 TRAPPC10P48553 1259 aa16.57■□□□□ 0.24
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SH3BP1-205ENST00000466097 METTL13Q8N6R0 699 aa16.57■□□□□ 0.24
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SH3BP1-205ENST00000466097 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF576Q9H609 170 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC28A3Q9HAS3 691 aa16.56■□□□□ 0.24
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SH3BP1-205ENST00000466097 WNT7AO00755 349 aa16.55■□□□□ 0.24
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SH3BP1-205ENST00000466097 FTHL17Q9BXU8 183 aa16.53■□□□□ 0.24
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SH3BP1-205ENST00000466097 MYOGP15173 224 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 CD52P31358 61 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 DNM2P50570 870 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 CYP4A11Q02928 519 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1-205ENST00000466097 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.24
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