RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 CALUO43852 315 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 BMP6P22004 513 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 COPB1P53618 953 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 MAP3K10Q02779 954 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 NR1I3Q14994 352 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 HYIQ5T013 277 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 TCP11Q8WWU5 503 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 STAMQ92783 540 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 EXOC4Q96A65 974 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 KBTBD13C9JR72 458 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 STRNO43815 780 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 LRMPQ12912 555 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 TCP11X2Q5H9J9 407 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 RGMBQ6NW40 437 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 TBC1D5Q92609 795 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 RMDN3Q96TC7 470 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 PLIN2Q99541 437 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 PLVAPQ9BX97 442 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 CNTNAP1P78357 1384 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 OAZ1P54368 228 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 NACC1Q96RE7 527 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 FNBP1Q96RU3 617 aa8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 CCDC169A6NNP5 214 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 PP2D1A8MPX8 630 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 SLC37A4O43826 429 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 PCK1P35558 622 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 PRCPP42785 496 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 SLC8A3P57103 927 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 CCZ1BP86790 482 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 GRB10Q13322 594 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 ALCAMQ13740 583 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 SLMAPQ14BN4 828 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 FAM71BQ8TC56 605 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 MYPNQ86TC9 1320 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PQC6 194 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 CDC25AP30304 524 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 ALDH3A1P30838 453 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 KIF5AQ12840 1032 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 GAP43P17677 238 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 ACTN2P35609 894 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 TNNC1P63316 161 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 UBXN1Q04323 297 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 FSTL1Q12841 308 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 TUFT1Q9NNX1 390 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 AKR1B10O60218 316 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 KPNA6O60684 536 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 ATP2C2O75185 946 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 P4HA1P13674 534 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 XKR9Q5GH70 373 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 PANK4Q9NVE7 773 aa8.35□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 SIPA1L1O43166 1804 aa8.34□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 TOMM70O94826 608 aa8.34□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 ICAM1P05362 532 aa8.34□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 PRMT2P55345 433 aa8.34□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 KRT31Q15323 416 aa8.34□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
USP54-210ENST00000466048 SEPT14Q6ZU15 432 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms