RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VAV3Q9UKW4 847 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GINS2Q9Y248 185 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDH23Q9H251 3354 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.22■■□□□ 1.15
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 C22orf31O95567 290 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYOGP15173 224 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PSMC5P62195 406 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LPIN1Q14693 890 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TCTN1Q2MV58 587 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 XKR3Q5GH77 459 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BANK1Q8NDB2 785 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HAS1Q92839 578 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAP7D2Q96T17 732 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 SQORQ9Y6N5 450 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CA3P07451 260 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FOSL2P15408 326 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MCM7P33993 719 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PAK2Q13177 524 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GRIN2CQ14957 1233 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAD9AQ99638 391 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AKT3Q9Y243 479 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EML1O00423 815 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DLL1O00548 723 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GJB5O95377 273 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EPHA7Q15375 998 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MTERF2Q49AM1 385 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ODR4Q5SWX8 454 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYLIPQ8WY64 445 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 H3BQV1 296 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CD52P31358 61 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TXKP42681 527 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNM2P50570 870 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLCN3P51790 818 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MCTP1Q6DN14 999 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCLT1Q96NL6 688 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VTNP04004 478 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GJB2P29033 226 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRAPPC10P48553 1259 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIZQ2M2Z5 673 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LXNQ9BS40 222 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 INSL6Q9Y581 213 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COL6A3P12111 3177 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPS6KA5O75582 802 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UPP2O95045 317 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TTC38Q5R3I4 469 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 YME1L1Q96TA2 773 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PADI3Q9ULW8 664 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYP4A11Q02928 519 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF174Q15697 407 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TPH2Q8IWU9 490 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NEK9Q8TD19 979 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DYDC2Q96IM9 177 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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