RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464280.5

NISCH-204, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 3

Gene NISCH, Length 833 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-204ENST00000464280 PBX4Q9BYU1 374 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 CDY2AQ9Y6F7 541 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 SQORQ9Y6N5 450 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 CDH23Q9H251 3354 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 COL6A3P12111 3177 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 TTC3P53804 2025 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 KIF28PB7ZC32 967 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 H3BQV1 296 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 EML1O00423 815 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 C22orf31O95567 290 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 ATP2B1P20020 1258 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 TMOD1P28289 359 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 MCM7P33993 719 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 QARSP47897 775 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 WDR5P61964 334 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 EPHA7Q15375 998 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 UGCGQ16739 394 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 Q7L0L9 218 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 METTL13Q8N6R0 699 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 BANK1Q8NDB2 785 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 ZBTB10Q96DT7 871 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 SEMA6BQ9H3T3 888 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 TRPV2Q9Y5S1 764 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 CHD7Q9P2D1 2997 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 GHRP10912 638 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 PBX2P40425 430 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 TXKP42681 527 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 SPIRE1Q08AE8 756 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 TMEM62Q0P6H9 643 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 FBXO47Q5MNV8 452 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 TTC38Q5R3I4 469 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 MCTP1Q6DN14 999 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 NCAPH2Q6IBW4 605 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 HERC6Q8IVU3 1022 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 MTMR9Q96QG7 549 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 ZNF576Q9H609 170 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 SLC28A3Q9HAS3 691 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-204ENST00000464280 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 WNT7AO00755 349 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 AMHP03971 560 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 RABGGTBP53611 331 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 CUL4AQ13619 759 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 LPIN1Q14693 890 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 ZNF174Q15697 407 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 TCTN1Q2MV58 587 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 MTERF2Q49AM1 385 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 ODR4Q5SWX8 454 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 EFCAB12Q6NXP0 572 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 C4orf19Q8IY42 314 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 EXOC8Q8IYI6 725 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 NEK9Q8TD19 979 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 FAM161BQ96MY7 647 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 MAP7D2Q96T17 732 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 LXNQ9BS40 222 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 PPME1Q9Y570 386 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 TLL1O43897 1013 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 OR52Z1P0C646 297 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 DNM2P50570 870 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 DEFB103AP81534 67 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 CDC42EP1Q00587 391 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 OTUD6AQ7L8S5 288 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 DYDC2Q96IM9 177 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 FTHL17Q9BXU8 183 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 OSBPL7Q9BZF2 842 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 TMEM60Q9H2L4 133 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 SUGCTQ9HAC7 445 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 AKT3Q9Y243 479 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 GINS2Q9Y248 185 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 MYH15Q9Y2K3 1946 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 LAD1O00515 517 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 STBD1O95210 358 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 GJB5O95377 273 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 PDCP20941 246 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 YWHABP31946 246 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 CLCN3P51790 818 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 CYP4A11Q02928 519 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-204ENST00000464280 PAK2Q13177 524 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms