RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CPLX1O14810 134 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 ADAMTS3O15072 1205 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 VTNP04004 478 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP3A4P08684 503 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 HSPA4P34932 840 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 STK3Q13188 491 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF169Q8NCN4 708 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM122AQ96E09 287 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 ADAM2Q99965 735 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CD320Q9NPF0 282 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 AKT3Q9Y243 479 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 SQORQ9Y6N5 450 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 TBKBP1A7MCY6 615 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 GPR182O15218 404 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 NCK2O43639 380 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 COL1A2P08123 1366 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFV1P49821 464 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 RCAN1P53805 252 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 PKN1Q16512 942 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 MAP7D2Q96T17 732 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 OSMRQ99650 979 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 PLVAPQ9BX97 442 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 AAASQ9NRG9 546 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 ESYT2A0FGR8 921 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 WDR64B1ANS9 1081 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 C5orf67F2Z3F1 127 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC01565O15544 149 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 MARCH6O60337 910 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 GAS7O60861 476 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 ITGB1P05556 798 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 NEFLP07196 543 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP4AP20648 1035 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 TMOD1P28289 359 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CA8P35219 290 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CLCN3P51790 818 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 HYAL1Q12794 435 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM102BQ5T8I3 360 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 RUFY3Q7L099 469 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 NEK9Q8TD19 979 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 POF1BQ8WVV4 589 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 GJA10Q969M2 543 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms