RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 DDAH1O94760 285 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 STAT5BP51692 787 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 ANTXR2P58335 489 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 ACTR2P61160 394 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 KCNC3Q14003 757 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 SYCE2Q6PIF2 218 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 KREMEN2Q8NCW0 462 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 TCF25Q9BQ70 676 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 PLEKHA8P1O95397 391 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 LAG3P18627 525 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 SMARCA1P28370 1054 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 PTH1RQ03431 593 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 SLC24A5Q71RS6 500 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 ASCL5Q7RTU5 278 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 MAP3K14Q99558 947 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 LZTS2Q9BRK4 669 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 SDF4Q9BRK5 362 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 RGS18Q9NS28 235 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 NR2E1Q9Y466 385 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 PROB1E7EW31 1015 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 FGFR1P11362 822 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 MTMR3Q13615 1198 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM40Q8WWA1 233 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 KCNH7Q9NS40 1196 aa26.55■■□□□ 1.84
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PTPRA-208ENST00000455631 LZTS1Q9Y250 596 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 C9IYK1 514 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 ODR4Q5SWX8 454 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 CWH43Q9H720 699 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 CDHR5Q9HBB8 845 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 LY9Q9HBG7 655 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 CDH22Q9UJ99 828 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 SORCS3Q9UPU3 1222 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 HIDE1A8MVS5 230 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 IGHDP01880 384 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 KLRC1P26715 233 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 PDE4AP27815 886 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 GNAQP50148 359 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 UBALD2Q8IYN6 164 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 PPP1R16BQ96T49 567 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 GPR182O15218 404 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 NFASCO94856 1347 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 PLCB3Q01970 1234 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM105Q8N8V8 129 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 MXRA8Q9BRK3 442 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM161AQ9NX61 479 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 MYO15AQ9UKN7 3530 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRA-208ENST00000455631 PRR23AA6NEV1 266 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 BRD1O95696 1058 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 RXRAP19793 462 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 SLC26A2P50443 739 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 NFXL1Q6ZNB6 911 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 CYP2W1Q8TAV3 490 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 CASP10Q92851 521 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 EVPLQ92817 2033 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 C2CD4DB7Z1M9 353 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 CES5AQ6NT32 575 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 CASC1Q6TDU7 716 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 OSMRQ99650 979 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 POMKQ9H5K3 350 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 BACH1O14867 736 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 HBP1O60381 514 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 ARP10275 920 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 PBX3P40426 434 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 NBL1P41271 181 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 AAMPQ13685 434 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 KIZQ2M2Z5 673 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 TMC7Q7Z402 723 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 FAM228AQ86W67 206 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 NECTIN4Q96NY8 510 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM117Q9H0C3 514 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 SMOC2Q9H3U7 446 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 MYO10Q9HD67 2058 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 CCDC69A6NI79 296 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 PPM1AP35813 382 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRA-208ENST00000455631 KRT17Q04695 432 aa26.48■■□□□ 1.83
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