RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439247.2

PCNX3-202, Transcript of pecanex 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCNX3, Length 3,104 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX3-202ENST00000439247 GPSM2P81274 684 aa14.77□□□□□ -0.04
PCNX3-202ENST00000439247 MYO1EQ12965 1108 aa14.77□□□□□ -0.04
PCNX3-202ENST00000439247 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PCNX3-202ENST00000439247 MTMR9Q96QG7 549 aa14.77□□□□□ -0.04
PCNX3-202ENST00000439247 GANQ9H2C0 597 aa14.77□□□□□ -0.04
PCNX3-202ENST00000439247 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.77□□□□□ -0.04
PCNX3-202ENST00000439247 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PCNX3-202ENST00000439247 PPIP5K2O43314 1243 aa14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 SEMA3FQ13275 785 aa14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.052e-6■■□□□ 12.9
PCNX3-202ENST00000439247 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 E9PMD0 336 aa14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 UBE4AQ14139 1066 aa14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 C12orf60Q5U649 245 aa14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 PEX26Q7Z412 305 aa14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 GLG1Q92896 1179 aa14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 PANK4Q9NVE7 773 aa14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.77□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 HGSO14964 777 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 EPS15P42566 896 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 SLCO1A2P46721 670 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 KCNH2Q12809 1159 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 GRIK5Q16478 980 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 C6orf50Q9HD87 102 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 NAGPAQ9UK23 515 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 MMEP08473 750 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 DAAM2Q86T65 1068 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.76□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ABCB11O95342 1321 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 FGGP02679 453 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 PAEPP09466 180 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 CCDC38Q502W7 563 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 AADACL2Q6P093 401 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.058e-7■□□□□ 10.9
PCNX3-202ENST00000439247 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 SPAG5Q96R06 1193 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 GNAQP50148 359 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 CASP5P51878 434 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 UBE2SQ16763 222 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 SBK1Q52WX2 424 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 SOGA3Q5TF21 947 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 GALNT17Q6IS24 598 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 TEX11Q8IYF3 940 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 A8MUI8 341 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 KCNJ2P63252 427 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 ADAM9Q13443 819 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 PBKQ96KB5 322 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 AZI2Q9H6S1 392 aa14.75□□□□□ -0.05
PCNX3-202ENST00000439247 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.5 ms