RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
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PTPRK-212ENST00000434424 CYP17A1P05093 508 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 CD40P25942 277 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 MIER2Q8N344 545 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
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PTPRK-212ENST00000434424 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 TAAR9Q96RI9 348 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 POGZQ7Z3K3 1410 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 NRDCO43847 1150 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 COL6A2P12110 1019 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 RAPGEF1Q13905 1077 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF124Q15973 351 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 NLRP10Q86W26 655 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 DPF3Q92784 378 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 GJA10Q969M2 543 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
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PTPRK-212ENST00000434424 ORAI2Q96SN7 254 aa9□□□□□ -0.97
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PTPRK-212ENST00000434424 ZMAT4Q9H898 229 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 DNAJC28Q9NX36 388 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 DUSP13Q9UII6 198 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 DNM3Q9UQ16 869 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 PTPN22Q9Y2R2 807 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 DISP1Q96F81 1524 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 WASH4PA8MWX3 477 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 SCDO00767 359 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 LTKP29376 864 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 GJA9P57773 515 aa8.99□□□□□ -0.97
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PTPRK-212ENST00000434424 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 GOLGA3Q08378 1498 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 LCHNA4D1U4 455 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 BIN1O00499 593 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 TCEA3O75764 348 aa8.98□□□□□ -0.97
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PTPRK-212ENST00000434424 RHDQ02161 417 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 H3BS24 57 aa8.97□□□□□ -0.97
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PTPRK-212ENST00000434424 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 FGAP02671 866 aa8.97□□□□□ -0.97
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PTPRK-212ENST00000434424 FPR2P25090 351 aa8.97□□□□□ -0.97
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PTPRK-212ENST00000434424 PRKCQQ04759 706 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 GAB4Q2WGN9 574 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 FIGNQ5HY92 759 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 ERAP2Q6P179 960 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 ZPBP2Q6X784 338 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 Q8N1Y9 231 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 DLG3Q92796 817 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 UBE2FQ969M7 185 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-212ENST00000434424 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.97□□□□□ -0.97
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