RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 BCORQ6W2J9 1755 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PPC1 479 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 RAD17O75943 681 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 CYBBP04839 570 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 TM4SF4P48230 202 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 FKBP1BP68106 108 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 CAP1Q01518 475 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 VWA3BQ502W6 1294 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 OTOP1Q7RTM1 612 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 JAMLQ86YT9 394 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 FIBCD1Q8N539 461 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 DEFB123Q8N688 67 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 ERO1AQ96HE7 468 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 SLC52A2Q9HAB3 445 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-211ENST00000429595 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PQ27 194 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PQ64 194 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PQC6 194 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PQD8 194 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 IFNGR1P15260 489 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 ATF2P15336 505 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 SLURP1P55000 103 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGEF6Q15052 776 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 ARMC5Q96C12 935 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 TM9SF2Q99805 663 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 IMPDH2P12268 514 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 PFKLP17858 780 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 CD247P20963 164 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 TACR1P25103 407 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 TCIRG1Q13488 830 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 GGNQ86UU5 652 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 CDCA5Q96FF9 252 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 PTCHD1Q96NR3 888 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GTL3 188 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 CAMTA2O94983 1202 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF394Q53GI3 561 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 BICRALQ6AI39 1079 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 PPT2Q9UMR5 302 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 CBFA2T2O43439 604 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 CD3EP07766 207 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 PLA2G5P39877 138 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 PRR5P85299 388 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 DPF2Q92785 391 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 COL4A5P29400 1685 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 SHTN1A0MZ66 631 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 A1BGP04217 495 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 GUCY2CP25092 1073 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF76P36508 570 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 MC3RP41968 323 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 KCNC1P48547 511 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 CORO7P57737 925 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 INHBEP58166 350 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 FOXO4P98177 505 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 FANCCQ00597 558 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 RTP5Q14D33 572 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF333Q96JL9 665 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 NYXQ9GZU5 481 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 POLKQ9UBT6 870 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-211ENST00000429595 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms