RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428683.5

ZNF3-208, Transcript of zinc finger protein 3, human

TSL 2

Gene ZNF3, Length 999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF3-208	ENST00000428683	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-208	ENST00000428683	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-208	ENST00000428683	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-208	ENST00000428683	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF3-208	ENST00000428683	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	KAT6A	Q92794	2004 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	CPLX1	O14810	134 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	MSH4	O15457	936 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	CHMP2A	O43633	222 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	VTN	P04004	478 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	LINC00271	P0C7V0	271 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	STAG3L1	P0CL83	205 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	IL9	P15248	144 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	COL9A1	P20849	921 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	EVC	P57679	992 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	IGFLR1	Q9H665	355 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	NID2	Q14112	1375 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	MGEA5	O60502	916 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	NEFL	P07196	543 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	USP11	P51784	963 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	TBCK	Q8TEA7	893 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	LENG9	Q96B70	501 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	AIFM3	Q96NN9	605 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	OSMR	Q99650	979 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	ADAM2	Q99965	735 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	CD320	Q9NPF0	282 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	DISC1	Q9NRI5	854 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	CLDND1	Q9NY35	253 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	COL1A2	P08123	1366 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	DENND3	A2RUS2	1198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	WDR64	B1ANS9	1081 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	GPR182	O15218	404 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	ZNF862	O60290	1169 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	GAS7	O60861	476 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	DEXI	O95424	95 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	C22orf31	O95567	290 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	CLCN3	P51790	818 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	BLID	Q8IZY5	108 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	RGS18	Q9NS28	235 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	AKT3	Q9Y243	479 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	REV3L	O60673	3130 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	MAGEB2	O15479	319 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	GPR32	O75388	356 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	TDP2	O95551	362 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	ITGB1	P05556	798 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	DNAJB1	P25685	340 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	CLUL1	Q15846	466 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	UGCG	Q16739	394 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-208	ENST00000428683	ODR4	Q5SWX8	454 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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