RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 LONRF3Q496Y0 759 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 XKR9Q5GH70 373 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 GPT2Q8TD30 523 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 CUEDC2Q9H467 287 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 DACT1Q9NYF0 836 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 USP25Q9UHP3 1055 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 HAS3O00219 553 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 HBP1O60381 514 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 KINO60870 393 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 PLA2G4BP0C869 781 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 NPEPPSP55786 919 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 MCM6Q14566 821 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 MTERF2Q49AM1 385 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 CEP170P1Q96L14 293 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 PHF24Q9UPV7 400 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 SLFN14P0C7P3 912 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 RARRES1P49788 294 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 CNNM3Q8NE01 707 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1W2PQY0 241 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 PPFIA1Q13136 1202 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 C7orf31Q8N865 590 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXA4-202ENST00000428284 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 INSRRP14616 1297 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 IGBP1P78318 339 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 SV2BQ7L1I2 683 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 SLC12A3P55017 1021 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 GRIK4Q16099 956 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 STAMQ92783 540 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 TNMDQ9H2S6 317 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 COL1A2P08123 1366 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 AFMP43652 599 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 PADI6Q6TGC4 694 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 GPBP1Q86WP2 473 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 TIGD1Q96MW7 591 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 ITGA7Q13683 1181 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 SETD4Q9NVD3 440 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 NRCAMQ92823 1304 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 AMPD3Q01432 767 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 KANK3Q6NY19 840 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 PAGE5Q96GU1 130 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 PPME1Q9Y570 386 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 GRIN2DO15399 1336 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 DGAT1O75907 488 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 CAPN2P17655 700 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 MTRQ99707 1265 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 GNAT1P11488 350 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 CYP11B2P19099 503 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 RFC5P40937 340 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 EMC2Q15006 297 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 CEP89Q96ST8 783 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA4-202ENST00000428284 KCND2Q9NZV8 630 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms