RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.79■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 ODR4Q5SWX8 454 aa23.79■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.79■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 P2RX5Q93086 422 aa23.79■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.79■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.79■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.79■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 NCK2O43639 380 aa23.78■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 C22orf31O95567 290 aa23.78■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 PSAPP07602 524 aa23.78■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 USP11P51784 963 aa23.78■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 PRR16Q569H4 304 aa23.78■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.78■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.78■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 TMX1Q9H3N1 280 aa23.78■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.78■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 WDR81Q562E7 1941 aa23.77■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 MMP1P03956 469 aa23.77■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.77■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 FAM167AQ96KS9 214 aa23.77■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.77■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.77■■□□□ 1.4
LIMS1-208ENST00000428064 WDR64B1ANS9 1081 aa23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 GRM6O15303 877 aa23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 EDIL3O43854 480 aa23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 RPS6KA5O75582 802 aa23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 COL9A1P20849 921 aa23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM40Q8WWA1 233 aa23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 RIT2Q99578 217 aa23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 GRXCR2A6NFK2 248 aa23.75■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.75■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.75■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.75■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.75■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 EVPLQ92817 2033 aa23.74■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 GPR182O15218 404 aa23.74■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEB2O15479 319 aa23.74■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.74■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.74■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 CDHR5Q9HBB8 845 aa23.74■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 RGS18Q9NS28 235 aa23.74■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.74■■□□□ 1.39
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LIMS1-208ENST00000428064 GPR32O75388 356 aa23.73■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 DEXIO95424 95 aa23.73■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 SFNP31947 248 aa23.73■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 NLRP5P59047 1200 aa23.73■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.73■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.73■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 SLC5A5Q92911 643 aa23.73■■□□□ 1.39
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LIMS1-208ENST00000428064 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.73■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa23.73■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.73■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 GINS2Q9Y248 185 aa23.73■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 SAMM50Q9Y512 469 aa23.73■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
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LIMS1-208ENST00000428064 PPFIA3O75145 1194 aa23.72■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 IL9P15248 144 aa23.72■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 Q4G0T1 1027 aa23.72■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 GALNT17Q6IS24 598 aa23.72■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.72■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 RDM1Q8NG50 284 aa23.72■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 DISC1Q9NRI5 854 aa23.72■■□□□ 1.39
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LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.72■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.71■■□□□ 1.39
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LIMS1-208ENST00000428064 C9IYK1 514 aa23.71■■□□□ 1.39
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LIMS1-208ENST00000428064 OATP04181 439 aa23.71■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 CYP3A7P24462 503 aa23.71■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 JAK3P52333 1124 aa23.71■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 HYAL1Q12794 435 aa23.71■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 CAMK1Q14012 370 aa23.71■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 KIZQ2M2Z5 673 aa23.71■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.71■■□□□ 1.39
LIMS1-208ENST00000428064 FAM228AQ86W67 206 aa23.71■■□□□ 1.39
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LIMS1-208ENST00000428064 OSMRQ99650 979 aa23.71■■□□□ 1.39
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