RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 BPIFB4P59827 614 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 SERPINB13Q9UIV8 391 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 SPAG7O75391 227 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 SASH1O94885 1247 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 BIRC2Q13490 618 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 SMYD3Q9H7B4 428 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 ATICP31939 592 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 DNAAF3Q8N9W5 541 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 KCNG1Q9UIX4 513 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 NLRP14Q86W24 1093 aa15.58■□□□□ 0.09
PTPRU-204ENST00000428026 ECE2O60344 883 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 ADD2P35612 726 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 NECTIN1Q15223 517 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 SPOPLQ6IQ16 392 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 NFRKBQ6P4R8 1299 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 FGD4Q96M96 766 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 GMNCA6NCL1 334 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 CREB3O43889 395 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 HSPA6P17066 643 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 SLC16A2P36021 539 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 PLCB4Q15147 1175 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 PARP9Q8IXQ6 854 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC17Q96LX7 622 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 KCTD1Q719H9 257 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 PYROXD1Q8WU10 500 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 COA7Q96BR5 231 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 PIGSQ96S52 555 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 SPC25Q9HBM1 224 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 STK17AQ9UEE5 414 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 SAYSD1Q9NPB0 183 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 CCPG1Q9ULG6 757 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM66O15016 1216 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 DCTN3O75935 186 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 DYNLL2Q96FJ2 89 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 DIP2AQ14689 1571 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC14Q15048 493 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 ORC6Q9Y5N6 252 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 GOLGA8OA6NCC3 632 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 RASA4BC9J798 803 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 GOLGA8NF8WBI6 632 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 RASA4O43374 803 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 RANBP1P43487 201 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 MUM1L1Q5H9M0 696 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 RESP18Q5W5W9 173 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM11Q96F44 468 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 DNAJC24Q6P3W2 148 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 KCTD6Q8NC69 237 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 TLK1Q9UKI8 766 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 SLC4A1P02730 911 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 OATP04181 439 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 KITP10721 976 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 IFNAR1P17181 557 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 SPARCL1Q14515 664 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 DCTN4Q9UJW0 460 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 GSTA4O15217 222 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 DDIT3P35638 169 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 IGBP1P78318 339 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 TMPRSS15P98073 1019 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 FAM149B1Q96BN6 582 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 ZFP69BQ9UJL9 534 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 PRPSAP1Q14558 356 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 RFX8Q6ZV50 586 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 MIS12Q9H081 205 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 CD209Q9NNX6 404 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 TECPR2O15040 1411 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 PPP2R2AP63151 447 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 DPP9Q86TI2 863 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM55Q9BYV6 548 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 ECT2Q9H8V3 914 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 PI4KBQ9UBF8 816 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 GUCY1A3Q02108 690 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 SEPT2Q15019 361 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRU-204ENST00000428026 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms