RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 SPATA20Q8TB22 786 aa16.01■□□□□ 0.15
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SFTA3-201ENST00000418548 INSRRP14616 1297 aa15.96■□□□□ 0.15
SFTA3-201ENST00000418548 RFC5P40937 340 aa15.96■□□□□ 0.15
SFTA3-201ENST00000418548 KCNB1Q14721 858 aa15.96■□□□□ 0.15
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SFTA3-201ENST00000418548 MTERF2Q49AM1 385 aa15.96■□□□□ 0.15
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