RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 DLGAP5Q15398 846 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SFR1Q86XK3 245 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SPDYE6P0CI01 402 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 TNNC1P63316 161 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SKOR1P84550 965 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 GIT2Q14161 759 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 NFKBIEO00221 500 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 POLD1P28340 1107 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 USP11P51784 963 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 REEP2Q9BRK0 252 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ZEB2O60315 1214 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 MYBP10242 640 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 OGFOD1Q8N543 542 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 IDI2Q9BXS1 227 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP104O60308 925 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXD13P35453 343 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ECE1P42892 770 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF4AO95239 1232 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PON1P27169 355 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ICA1Q05084 483 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 FZD1Q9UP38 647 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PRELPP51888 382 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP4P98171 946 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMD1Q99460 953 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 NAGPAQ9UK23 515 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 DNM3Q9UQ16 869 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 MEIS2O14770 477 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAP3O75969 853 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 RSPH10BP0C881 870 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 LIG3P49916 1009 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP4A11Q02928 519 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 MREGQ8N565 214 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 WHAMMQ8TF30 809 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFAB1O14561 156 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP3A7P24462 503 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CASP4P49662 377 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVK-9P63128 1117 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 GUCY1A3Q02108 690 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 GJB7Q6PEY0 223 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 GMLQ99445 158 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 MTFR1LQ9H019 292 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM107BQ9H098 131 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PRG0 241 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CLIC2O15247 247 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 USH1GQ495M9 461 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms