RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

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Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 USP17L15C9J2P7 530 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 USP17L11C9JVI0 530 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 USP17L18D6R9N7 530 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 USP17L22D6RA61 530 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 USP17L19D6RCP7 530 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 USP17L20D6RJB6 530 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 MEIS1O00470 390 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 FGGP02679 453 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 SCTRP47872 440 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 USP17L24Q0WX57 530 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 SFR1Q86XK3 245 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 HES6Q96HZ4 224 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 PSMD1Q99460 953 aa20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 USP17L10C9JJH3 530 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 F8W031 263 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 DRD4P21917 467 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 CDR1P51861 262 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 JAM2P57087 298 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 NARFQ9UHQ1 456 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 PNMA2Q9UL42 364 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 OPLAHO14841 1288 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 CAND2O75155 1236 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 SHBGP04278 402 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC172P0C7W6 258 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 GALCP54803 685 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF543Q08ER8 600 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 CPLX4Q7Z7G2 160 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NEFHP1-201ENST00000412845 GFPT2O94808 682 aa20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 GIT2Q14161 759 aa20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 TLCD1Q96CP7 247 aa20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 GCNT4Q9P109 453 aa20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 KCNA1Q09470 495 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 PICALMQ13492 652 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 KCTD1Q719H9 257 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 CCT6BQ92526 530 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 FMO2Q99518 471 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 REEP2Q9BRK0 252 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 CD209Q9NNX6 404 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 CLIC2O15247 247 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 PPFIA2O75334 1257 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 RSPH10BP0C881 870 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 SNCBQ16143 134 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC35C1Q96A29 364 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 SGSM3Q96HU1 749 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 MCM8Q9UJA3 840 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.44■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.43■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 CEP57Q86XR8 500 aa20.43■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 GLG1Q92896 1179 aa20.43■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 HVCN1Q96D96 273 aa20.43■□□□□ 0.86
NEFHP1-201ENST00000412845 AMFRQ9UKV5 643 aa20.43■□□□□ 0.86
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