RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 EML1O00423 815 aa23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 NBNO60934 754 aa23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 BAIAP3O94812 1187 aa23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 PSMC5P62195 406 aa23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 FAM26DQ5JW98 314 aa23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 VWCEQ96DN2 955 aa23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 CFAP45Q9UL16 551 aa23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 SIP14410 1827 aa23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 KLRC1P26715 233 aa23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 TXKP42681 527 aa23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 MBTPS1Q14703 1052 aa23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 EPHA7Q15375 998 aa23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 XKR3Q5GH77 459 aa23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 GPR153Q6NV75 609 aa23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 BANK1Q8NDB2 785 aa23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 TET1Q8NFU7 2136 aa23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 MAGEB2O15479 319 aa23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 C22orf31O95567 290 aa23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 PRPHP41219 470 aa23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 KRT85P78386 507 aa23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 GPNMBQ14956 572 aa23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 STK38Q15208 465 aa23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 IER5Q5VY09 327 aa23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 NEK9Q8TD19 979 aa23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 LRCH3Q96II8 777 aa23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.27■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 EFCAB14O75071 495 aa23.26■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 YEATS4O95619 227 aa23.26■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 PTPAQ15257 358 aa23.26■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 NME8Q8N427 588 aa23.26■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 LXNQ9BS40 222 aa23.26■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.26■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 KCNJ6P48051 423 aa23.25■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 MGAT3Q09327 533 aa23.25■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.25■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 SLC39A14Q15043 492 aa23.25■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.25■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 SEPT8Q92599 483 aa23.25■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 SLC9A7Q96T83 725 aa23.25■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 RAB34Q9BZG1 259 aa23.25■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.25■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 EVPLQ92817 2033 aa23.25■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.24■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 CHRNA1P02708 482 aa23.24■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 TMOD1P28289 359 aa23.24■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 IKBKEQ14164 716 aa23.24■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.24■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 METTL13Q8N6R0 699 aa23.24■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.24■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 APBB2Q92870 758 aa23.24■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 MAP7D2Q96T17 732 aa23.24■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.24■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.23■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.23■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 TECP42680 631 aa23.23■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 CYP4A11Q02928 519 aa23.23■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 MTERF2Q49AM1 385 aa23.23■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 C4orf19Q8IY42 314 aa23.23■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 DYDC2Q96IM9 177 aa23.23■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 PPME1Q9Y570 386 aa23.23■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 ARID2Q68CP9 1835 aa23.23■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 POTEMA6NI47 508 aa23.22■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 SPTLC2O15270 562 aa23.22■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 GHRP10912 638 aa23.22■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.22■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.22■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 USP38Q8NB14 1042 aa23.22■■□□□ 1.31
C4orf48-201ENST00000409248 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms