RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 FTCDO95954 541 aa25.27■■□□□ 1.64
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RABGGTA-202ENST00000399409 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.27■■□□□ 1.64
RABGGTA-202ENST00000399409 VPS36Q86VN1 386 aa25.27■■□□□ 1.64
RABGGTA-202ENST00000399409 FLOT1O75955 427 aa25.26■■□□□ 1.63
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RABGGTA-202ENST00000399409 MKNK1Q9BUB5 465 aa25.26■■□□□ 1.63
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RABGGTA-202ENST00000399409 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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RABGGTA-202ENST00000399409 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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RABGGTA-202ENST00000399409 MS4A14Q96JA4 679 aa25.26■■□□□ 1.63
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RABGGTA-202ENST00000399409 GDF3Q9NR23 364 aa25.25■■□□□ 1.63
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RABGGTA-202ENST00000399409 YDJCA8MPS7 323 aa25.23■■□□□ 1.63
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RABGGTA-202ENST00000399409 KIF4AO95239 1232 aa25.21■■□□□ 1.63
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RABGGTA-202ENST00000399409 VCPKMTQ9H867 229 aa25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-202ENST00000399409 HSF2BPO75031 334 aa25.2■■□□□ 1.63
RABGGTA-202ENST00000399409 H2AFZP0C0S5 128 aa25.2■■□□□ 1.63
RABGGTA-202ENST00000399409 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
RABGGTA-202ENST00000399409 H2AFVQ71UI9 128 aa25.2■■□□□ 1.63
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