RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 FUT2Q10981 343 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD42-202ENST00000393389 WHAMMQ8TF30 809 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD42-202ENST00000393389 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD42-202ENST00000393389 CEP83Q9Y592 693 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD42-202ENST00000393389 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
ANKRD42-202ENST00000393389 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 LMNB1P20700 586 aa9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CRKP46108 304 aa9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 KCNJ1P48048 391 aa9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 GALCP54803 685 aa9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PSMC6P62333 389 aa9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TRADDQ15628 312 aa9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ICE2Q659A1 982 aa9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PASD1Q8IV76 773 aa9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 KIFAP3Q92845 792 aa9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SAAL1Q96ER3 474 aa9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 MXRA7P84157 204 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC63Q8NA47 563 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC17Q96LX7 622 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PI4KBQ9UBF8 816 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 APBA3O96018 575 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 FTLP02792 175 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 KRT19P08727 400 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 FGFR4P22455 802 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF131P52739 623 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TRAF1Q13077 416 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 EPC2Q52LR7 807 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF394Q53GI3 561 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 C2CD6Q53TS8 623 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 NLRP14Q86W24 1093 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PBKQ96KB5 322 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 RAB21Q9UL25 225 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 WDR91A4D1P6 747 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 MED24O75448 989 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 GAS8O95995 478 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 MMP10P09238 476 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ITGA4P13612 1032 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 MXI1P50539 228 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SESN3P58005 492 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 DYNLT1P63172 113 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SGO2Q562F6 1265 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PROM2Q8N271 834 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TTC16Q8NEE8 873 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 NEK9Q8TD19 979 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CCT8L2Q96SF2 557 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM51Q9NW97 253 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 RNF14Q9UBS8 474 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CACNA1FO60840 1977 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ABCB11O95342 1321 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 A6NNZ2 444 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 MAP2K7O14733 419 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC16A4O15374 487 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP1R37O75864 691 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 MMEP08473 750 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 LSP1P33241 339 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 STAT2P52630 851 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SETDB1Q15047 1291 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 WDR93Q6P2C0 686 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 C16orf86Q6ZW13 317 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CHURC1Q8WUH1 139 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKS1AQ92625 1134 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 IKZF4Q9H2S9 585 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 AZI2Q9H6S1 392 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 KCND1Q9NSA2 647 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 AKAP12Q02952 1782 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9.38□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ZBTB39O15060 712 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms