RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR64B1ANS9 1081 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 MCM7P33993 719 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 STAT5BP51692 787 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 NBR1Q14596 966 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 PLCB4Q15147 1175 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF174Q15697 407 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 DNAJB3Q8WWF6 145 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 SEPT8Q92599 483 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 RAD9AQ99638 391 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 AZI2Q9H6S1 392 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 DISC1Q9NRI5 854 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa30.58■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 CHMP2AO43633 222 aa30.57■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 CALCRLQ16602 461 aa30.57■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 SWSAP1Q6NVH7 229 aa30.57■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 TAF2Q6P1X5 1199 aa30.57■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 MYOCDQ8IZQ8 938 aa30.57■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa30.57■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 MTMR9Q96QG7 549 aa30.57■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 MTCH2Q9Y6C9 303 aa30.57■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 BACH1O14867 736 aa30.56■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 MARCH6O60337 910 aa30.56■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 BAG4O95429 457 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 AMHP03971 560 aa30.56■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 RPAINQ86UA6 219 aa30.56■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 SLFN12Q8IYM2 578 aa30.56■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF302Q9NR11 478 aa30.56■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 TRPC6Q9Y210 931 aa30.56■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 PSAPP07602 524 aa30.55■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 JAK3P52333 1124 aa30.55■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 MGAT3Q09327 533 aa30.55■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP2R5CQ13362 524 aa30.55■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM160B1Q5W0V3 765 aa30.55■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa30.55■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 MTUS1Q9ULD2 1270 aa30.55■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 MTMR6Q9Y217 621 aa30.55■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 SAMM50Q9Y512 469 aa30.55■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa30.55■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 LINC01553A4QN01 128 aa30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 EML1O00423 815 aa30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 LPXNO60711 386 aa30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 GHRP10912 638 aa30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 SFNP31947 248 aa30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 GRB10Q13322 594 aa30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 MIER3Q7Z3K6 550 aa30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 RDM1Q8NG50 284 aa30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 GABBR1Q9UBS5 961 aa30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 RRN3P2A6NIE6 340 aa30.53■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP4AP20648 1035 aa30.53■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 SPIRE1Q08AE8 756 aa30.53■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 LPIN1Q14693 890 aa30.53■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 PDXDC2PQ6P474 469 aa30.53■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 FERMT3Q86UX7 667 aa30.53■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 C4orf32Q8N8J7 132 aa30.53■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 STX6O43752 255 aa30.52■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC26A2P50443 739 aa30.52■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 RILPL1Q5EBL4 403 aa30.52■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 CDY2AQ9Y6F7 541 aa30.52■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa30.51■■■□□ 2.48
GNPTAB-202ENST00000392919 POTEB3A0JP26 581 aa30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 UPP2O95045 317 aa30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 TXKP42681 527 aa30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 POTEBQ6S5H4 581 aa30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 BRAPQ7Z569 592 aa30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 RSPH3Q86UC2 560 aa30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 GDPD5Q8WTR4 605 aa30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 TOP1MTQ969P6 601 aa30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 THEGQ9P2T0 379 aa30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHA12Q9UN75 941 aa30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 INSL6Q9Y581 213 aa30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 VCANP13611 3396 aa30.51■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 ERVK-21P61565 698 aa30.5■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM62Q0P6H9 643 aa30.5■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 RESTQ13127 1097 aa30.5■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 UGCGQ16739 394 aa30.5■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 APBB2Q92870 758 aa30.5■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 SUGCTQ9HAC7 445 aa30.5■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 TRANK1O15050 2925 aa30.5■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF862O60290 1169 aa30.49■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 OR52Z1P0C646 297 aa30.49■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 FBXO47Q5MNV8 452 aa30.49■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP8B4Q8TF62 1192 aa30.49■■■□□ 2.47
GNPTAB-202ENST00000392919 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms