RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
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PAN3-201ENST00000380958 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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PAN3-201ENST00000380958 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.73■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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PAN3-201ENST00000380958 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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PAN3-201ENST00000380958 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 KCNH2Q12809 1159 aa21.72■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 ASIC2Q16515 512 aa21.71■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 STYK1Q6J9G0 422 aa21.71■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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PAN3-201ENST00000380958 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 CEP104O60308 925 aa21.71■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 RPL13P26373 211 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 IQCKQ8N0W5 287 aa21.71■■□□□ 1.07
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PAN3-201ENST00000380958 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.71■■□□□ 1.07
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PAN3-201ENST00000380958 PLAAQ9Y263 795 aa21.71■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.71■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.7■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.7■■□□□ 1.07
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PAN3-201ENST00000380958 NR1D1P20393 614 aa21.7■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 LSP1P33241 339 aa21.7■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 CACNB3P54284 484 aa21.7■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 REEP2Q9BRK0 252 aa21.7■■□□□ 1.07
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