RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.4□□□□□ -0.1
TMOD1-202ENST00000375175 NNTQ13423 1086 aa14.4□□□□□ -0.1
TMOD1-202ENST00000375175 PPP2R5AQ15172 486 aa14.4□□□□□ -0.1
TMOD1-202ENST00000375175 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.4□□□□□ -0.1
TMOD1-202ENST00000375175 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.4□□□□□ -0.1
TMOD1-202ENST00000375175 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.4□□□□□ -0.1
TMOD1-202ENST00000375175 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
TMOD1-202ENST00000375175 TAF4BQ92750 862 aa14.4□□□□□ -0.1
TMOD1-202ENST00000375175 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.4□□□□□ -0.1
TMOD1-202ENST00000375175 KRT12Q99456 494 aa14.4□□□□□ -0.1
TMOD1-202ENST00000375175 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.4□□□□□ -0.1
TMOD1-202ENST00000375175 ESYT3A0FGR9 886 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 GLI1P08151 1106 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 RSPH10BP0C881 870 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ALDH1B1P30837 517 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PTK2Q05397 1052 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 EPN3Q9H201 632 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 LTBP1Q14766 1721 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 RASSF9O75901 435 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM37O94972 964 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 GCNT3O95395 438 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 UCHL3P15374 230 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 CARSP49589 748 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SEC24CP53992 1094 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 Q4G0T1 1027 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 VEZTQ9HBM0 779 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 NFU1Q9UMS0 254 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.39□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 TBX3O15119 743 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 CLIC2O15247 247 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SMTNP53814 917 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 IFT88Q13099 833 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ALS2CLQ60I27 953 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SFI1A8K8P3 1242 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PDXKO00764 312 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 KCNK3O14649 394 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 MSH4O15457 936 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 AKAP3O75969 853 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 NDUFB10O96000 172 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PON1P27169 355 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 HOXD13P35453 343 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 RPS6KA1Q15418 735 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PTPROQ16827 1216 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 CAVIN3Q969G5 261 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 FAM20AQ96MK3 541 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 RGL1Q9NZL6 768 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 A6NNZ2 444 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 NR3C1P04150 777 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PAX7P23759 505 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 TNFRSF8P28908 595 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SREBF1P36956 1147 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PTGISQ16647 500 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 WLSQ5T9L3 541 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 CEP57Q86XR8 500 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 LENG9Q96B70 501 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 AFF2P51816 1311 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms