RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 DTNBO60941 627 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 LARGE1O95461 756 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 CTDNEP1O95476 244 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 TDP2O95551 362 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 NEK4P51957 841 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 LPIN1Q14693 890 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 ME3Q16798 604 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 Q4G0T1 1027 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.66□□□□□ -1.02
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SGMS1-201ENST00000361543 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 SPRED2Q7Z698 418 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 NECAB1Q8N987 351 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 PPM1EQ8WY54 764 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 ARNTL2Q8WYA1 636 aa8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 WASF1Q92558 559 aa8.66□□□□□ -1.02
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SGMS1-201ENST00000361543 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.66□□□□□ -1.02
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SGMS1-201ENST00000361543 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 TRPV2Q9Y5S1 764 aa8.66□□□□□ -1.02
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SGMS1-201ENST00000361543 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.65□□□□□ -1.02
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SGMS1-201ENST00000361543 C22orf31O95567 290 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 ATP4AP20648 1035 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 CYP3A7P24462 503 aa8.65□□□□□ -1.02
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SGMS1-201ENST00000361543 SFNP31947 248 aa8.65□□□□□ -1.02
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SGMS1-201ENST00000361543 INF2Q27J81 1249 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 MOXD1Q6UVY6 613 aa8.65□□□□□ -1.02
SGMS1-201ENST00000361543 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.65□□□□□ -1.02
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SGMS1-201ENST00000361543 ST18O60284 1047 aa8.64□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 LETM2Q2VYF4 491 aa8.64□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 SQORQ9Y6N5 450 aa8.64□□□□□ -1.03
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF862O60290 1169 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 JAK2O60674 1132 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 LPXNO60711 386 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 FDPSP14324 419 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 KRT2P35908 639 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 MCM2P49736 904 aa8.63□□□□□ -1.03
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