RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 SPRYD7Q5W111 196 aa21.17■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.17■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.17■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.17■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.17■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.17■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 BACH1O14867 736 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 GNA14O95837 355 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 TPM1P09493 284 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 TRIM14Q14142 442 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 MAN2A1Q16706 1144 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 VWA3BQ502W6 1294 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 XKR9Q5GH70 373 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 ANO5Q75V66 913 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 TMEM139Q8IV31 216 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 FGD4Q96M96 766 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 PANX2Q96RD6 677 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 PORCNQ9H237 461 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 CALUO43852 315 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 ZNF862O60290 1169 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 KCNJ6P48051 423 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 NPEPPSP55786 919 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 KCNA1Q09470 495 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 CST9Q5W186 159 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 CNGA4Q8IV77 575 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 NDST4Q9H3R1 872 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 EFCC1Q9HA90 598 aa21.16■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.15■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 CETN3O15182 167 aa21.15■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 STX10O60499 249 aa21.15■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 MFAP3LO75121 409 aa21.15■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.15■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.15■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.15■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 TIPINQ9BVW5 301 aa21.15■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.14■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 TGFB3P10600 412 aa21.14■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 NR2F2P24468 414 aa21.14■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 CCNA1P78396 465 aa21.14■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.14■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.14■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 KCND1Q9NSA2 647 aa21.14■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.14■□□□□ 0.98
UPP1-201ENST00000331803 SOCS7O14512 581 aa21.14■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 STBD1O95210 358 aa21.14■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 ATG7O95352 703 aa21.14■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 MARSP56192 900 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP6O43182 974 aa21.13■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 NEDD9Q14511 834 aa21.13■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 SYCP1Q15431 976 aa21.13■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 CCDC51Q96ER9 411 aa21.13■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 DRC1Q96MC2 740 aa21.13■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.13■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 UBE4BO95155 1302 aa21.13■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.13■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 MYH11P35749 1972 aa21.13■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 WDR81Q562E7 1941 aa21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 USP27XA6NNY8 438 aa21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 TGFB1I1O43294 461 aa21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 PLS3P13797 630 aa21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 CEP170P1Q96L14 293 aa21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 STRA6Q9BX79 667 aa21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 RPL13P26373 211 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 PRKCEQ02156 737 aa21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 KSR1Q8IVT5 923 aa21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 PTPN18Q99952 460 aa21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.12■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 TTC26A0AVF1 554 aa21.11■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R37O75864 691 aa21.11■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 NR3C1P04150 777 aa21.11■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 HUNKP57058 714 aa21.11■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 CHADLQ6NUI6 762 aa21.11■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.11■□□□□ 0.97
UPP1-201ENST00000331803 TRIM59Q8IWR1 403 aa21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms