RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331194.8

CCDC88C-201, Transcript of coiled-coil domain containing 88C, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CCDC88C, Length 3,104 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88C-201ENST00000331194 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 TOM1O60784 492 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 PMS2P54278 862 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 GJB7Q6PEY0 223 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 HOMEZQ8IX15 550 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 PIDD1Q9HB75 910 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 NAGPAQ9UK23 515 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 SNX3O60493 162 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 KIF5BP33176 963 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 LRRC63Q05C16 580 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 DOCK2Q92608 1830 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 MYH3P11055 1940 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 DPPA5A6NC42 116 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 CFAP73A6NFT4 308 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 USP17L8P0C7I0 530 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 ALADP13716 330 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 CHRNDQ07001 517 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 ADCY1Q08828 1119 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 TAF11Q15544 211 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 SOGA3Q5TF21 947 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 FITM2Q8N6M3 262 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 TBCKQ8TEA7 893 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 PDHA1P08559 390 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 FGRP09769 529 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 PRPHP41219 470 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 MSH2P43246 934 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 BLMHQ13867 455 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 DENND2CQ68D51 928 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 KSR1Q8IVT5 923 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 AK8Q96MA6 479 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 TSG101Q99816 390 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 GANQ9H2C0 597 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 CCND1P24385 295 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 NAPAP54920 295 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 HOOK3Q86VS8 718 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 ITFG2Q969R8 447 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 GDAP1Q8TB36 358 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 BARHL2Q9NY43 387 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 SMCO2A6NFE2 343 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 CCDC188H7C350 402 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 SLC37A4O43826 429 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 PPP1R2P41236 205 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 EPS15P42566 896 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 COPS2P61201 443 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 KLRC3Q07444 240 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 KCNH2Q12809 1159 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 PSMD2Q13200 908 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 LLGL1Q15334 1064 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 CNGA2Q16280 664 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 SUSD4Q5VX71 490 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 NEK9Q8TD19 979 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC88C-201ENST00000331194 TDP2O95551 362 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC88C-201ENST00000331194 ATP4AP20648 1035 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC88C-201ENST00000331194 ABCB4P21439 1286 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC88C-201ENST00000331194 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC88C-201ENST00000331194 DR1Q01658 176 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC88C-201ENST00000331194 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC88C-201ENST00000331194 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC88C-201ENST00000331194 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC88C-201ENST00000331194 SEC14L1Q92503 715 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC88C-201ENST00000331194 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC88C-201ENST00000331194 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC88C-201ENST00000331194 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms