RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329970.7

GTF3C6-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C6, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6-201ENST00000329970 PSAPP07602 524 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 CD52P31358 61 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 TIGD5Q53EQ6 642 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 ODR4Q5SWX8 454 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 MOXD1Q6UVY6 613 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 FIBCD1Q8N539 461 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 ZBTB10Q96DT7 871 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 FAM167AQ96KS9 214 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 PADI3Q9ULW8 664 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 PCDHA4Q9UN74 947 aa15.38■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 WDR64B1ANS9 1081 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 CPLX1O14810 134 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 C22orf31O95567 290 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 CYP3A7P24462 503 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 SFNP31947 248 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 KCNQ1P51787 676 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 NLRP5P59047 1200 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 ANAPC15P60006 121 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 PAK2Q13177 524 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 Q4G0T1 1027 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 NPAS4Q8IUM7 802 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 LMAN2LQ9H0V9 348 aa15.37■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 MSH4O15457 936 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 MAGEB2O15479 319 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 STAG3L1P0CL83 205 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 BMPR1AP36894 532 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 JAK3P52333 1124 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 GPM6BQ13491 265 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 COL19A1Q14993 1142 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 NPY5RQ15761 445 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 RDM1Q8NG50 284 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 SLC5A5Q92911 643 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 MBOAT7Q96N66 472 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 PLVAPQ9BX97 442 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 ERVK-5Q9HDB9 667 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 PDRG1Q9NUG6 133 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 STK36Q9NRP7 1315 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 CDKL5O76039 1030 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 TMEM62Q0P6H9 643 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 NAALADL2Q58DX5 795 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 B3GNT9Q6UX72 402 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 BLIDQ8IZY5 108 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 LINC01465Q8N7H1 131 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 TBCKQ8TEA7 893 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 P2RX5Q93086 422 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 TEKT3Q9BXF9 490 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 TMX1Q9H3N1 280 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 DISC1Q9NRI5 854 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 C1orf112Q9NSG2 853 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 GABBR1Q9UBS5 961 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa15.35■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 GPR182O15218 404 aa15.34■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 PPFIA3O75145 1194 aa15.34■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 RPS6KA5O75582 802 aa15.34■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 PSMD10O75832 226 aa15.34■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 CTNNB1P35222 781 aa15.34■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 SARSP49591 514 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.34■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 BANK1Q8NDB2 785 aa15.34■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 TMEM40Q8WWA1 233 aa15.34■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
GTF3C6-201ENST00000329970 NCK2O43639 380 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF862O60290 1169 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 GAS7O60861 476 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 GPR32O75388 356 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 OATP04181 439 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 SCRN1Q12765 414 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 LRCH2Q5VUJ6 765 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 NEK9Q8TD19 979 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 RGS18Q9NS28 235 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 SAMM50Q9Y512 469 aa15.33■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 PFKFB2O60825 505 aa15.32■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 MMP1P03956 469 aa15.32■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 TMOD1P28289 359 aa15.32■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 ANKRD1Q15327 319 aa15.32■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 SLC24A5Q71RS6 500 aa15.32■□□□□ 0.04
GTF3C6-201ENST00000329970 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms