RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT76Q01546 638 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP4A11Q02928 519 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 STK4Q13043 487 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 FILIP1LQ4L180 1135 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 GPAT2Q6NUI2 795 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 B3GNT9Q6UX72 402 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSCAN30Q86W11 494 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 RDM1Q8NG50 284 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 DYDC2Q96IM9 177 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP42Q96MM3 310 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 UNC45AQ9H3U1 944 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 MROH8Q9H579 483 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 IMPACTQ9P2X3 320 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 RBPJLQ9UBG7 517 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 GDAQ9Y2T3 454 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 SAMM50Q9Y512 469 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ESPNB1AK53 854 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.614e-37■■■□□ 18.2
RABGGTB-201ENST00000319942 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP1A3P13637 1013 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF18P17022 549 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP11B2P19099 503 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ERCC3P19447 782 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 CCNE1P24864 410 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 MOGSQ13724 837 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD2Q14681 263 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 HSD3B7Q9H2F3 369 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC39A2Q9NP94 309 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 KCND2Q9NZV8 630 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 SCN4AP35499 1836 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR64B1ANS9 1081 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 SOCS7O14512 581 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 QARSP47897 775 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 GSDMDP57764 484 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMC6P62333 389 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL15Q16663 113 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM114A1Q8IWE2 563 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 SHCBP1Q8NEM2 672 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 P2RX5Q93086 422 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 MED15Q96RN5 788 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 PHOX2BQ99453 314 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 PDHXO00330 501 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 NRDCO43847 1150 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 TBCAO75347 108 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 LYPLA2O95372 231 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 TPM2P07951 284 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 FCER1AP12319 257 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 GAP43P17677 238 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 GJA5P36382 358 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 USP46P62068 366 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 GIT2Q14161 759 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXR2Q6PJQ5 311 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 MYOCDQ8IZQ8 938 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 TSG101Q99816 390 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 LXNQ9BS40 222 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-201ENST00000319942 ATAD5Q96QE3 1844 aa11.21□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 NFASCO94856 1347 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR37O15354 613 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP9AO75110 1047 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 CNMDO75829 334 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms