RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318066.6

UBE2N-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 N, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2N, Length 5,186 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2N-201ENST00000318066 MAML1Q92585 1016 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 FAM20AQ96MK3 541 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 TMPRSS15P98073 1019 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 IL1RL1Q01638 556 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 PRKG1Q13976 671 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 PROSER3Q2NL68 480 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 ACAD11Q709F0 780 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 SULF1Q8IWU6 871 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 SAAL1Q96ER3 474 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 GINM1Q9NU53 330 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 SENP1Q9P0U3 644 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 AKT3Q9Y243 479 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 NLRP10Q86W26 655 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 GDAP1Q8TB36 358 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 COX16Q9P0S2 106 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 PALMO75781 387 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 KRT82Q9NSB4 513 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 LARGE1O95461 756 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 IFNA8P32881 189 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 ARHGDIAP52565 204 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 RASA4BC9J798 803 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 RASA4O43374 803 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 CHGBP05060 677 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 MYBL1P10243 752 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 SLC7A5Q01650 507 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 OSBPP22059 807 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 DYNLT1P63172 113 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 OCRLQ01968 901 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 OCA2Q04671 838 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 FAM167AQ96KS9 214 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 K7ERI5 159 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 CDR2Q01850 454 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 PDCLQ13371 301 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 SASH1O94885 1247 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 ACSL3O95573 720 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 KCTD1Q719H9 257 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 COBLO75128 1261 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 ALX1Q15699 326 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 ABI1Q8IZP0 508 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 OLFM3Q96PB7 478 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 WDR64B1ANS9 1081 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 H7C1W4 665 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 HAUS5O94927 633 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 ADCY1Q08828 1119 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 KDM5CP41229 1560 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 PSMA2P25787 234 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 DOK7Q18PE1 504 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 COA7Q96BR5 231 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 USP21Q9UK80 565 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 ARHGAP10A1A4S6 786 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 E2F4Q16254 413 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 LRRC43Q8N309 656 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 BAG6P46379 1132 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 SERPINB4P48594 390 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2N-201ENST00000318066 PMS2P54278 862 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms