RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316786.1

C9orf106-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 106 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf106, Length 3,145 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106-201ENST00000316786 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 SAMM50Q9Y512 469 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 EYA4O95677 639 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 MYBL2P10244 700 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 MIIPQ5JXC2 388 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 ELP3Q9H9T3 547 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 PXMP2Q9NR77 195 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 TRAF5O00463 557 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 ARHGAP6O43182 974 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 USP8P40818 1118 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 CLCN6P51797 869 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 ADCY2Q08462 1091 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 OTUD5Q96G74 571 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 STX10O60499 249 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 GHRHRQ02643 423 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 ERO1AQ96HE7 468 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 RMI1Q9H9A7 625 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 CSADQ9Y600 493 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 TTC26A0AVF1 554 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 MYBP10242 640 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 LRRC63Q05C16 580 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 KCNA1Q09470 495 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 JADE2Q9NQC1 790 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM150BA6NC51 233 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 CCP110O43303 1012 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 SLC26A4O43511 780 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 SORBS3O60504 671 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 ELF1P32519 619 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 KRT9P35527 623 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 RIT2Q99578 217 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 SNX1Q13596 522 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 A0A0U1RQJ8 604 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 DNM2P50570 870 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 EPHA7Q15375 998 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 CNGA4Q8IV77 575 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 ATL2Q8NHH9 583 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 PANX2Q96RD6 677 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 TSG101Q99816 390 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 FDX1P10109 184 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 BCRP11274 1271 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 NF2P35240 595 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 HOXD13P35453 343 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 GADL1Q6ZQY3 521 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 TATDN2Q93075 761 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 SH3GL3Q99963 347 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 STK24Q9Y6E0 443 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 GCNT3O95395 438 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 NR3C2P08235 984 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf106-201ENST00000316786 EPHX2P34913 555 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms