RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 ASTN1O14525 1302 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 KCNK3O14649 394 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 TBCAO75347 108 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 FAM153BP0C7A2 387 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 GAP43P17677 238 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 CHRNA5P30532 468 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 GNGT1P63211 74 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 FAM153CQ494X1 144 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 SIAH1Q8IUQ4 282 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 OLFML3Q9NRN5 406 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 FAM153AQ9UHL3 310 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 VAV3Q9UKW4 847 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 INTUQ9ULD6 942 aa30.61■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 EYA4O95677 639 aa30.6■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 SLURP2P0DP57 97 aa30.6■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 JAM2P57087 298 aa30.6■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 LMBR1Q8WVP7 490 aa30.6■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 ESYT3A0FGR9 886 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 SHTN1A0MZ66 631 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 F5H6K3 240 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 MSH4O15457 936 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 NPM3O75607 178 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 KLRC3Q07444 240 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 C7orf43Q8WVR3 580 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 SLC35C1Q96A29 364 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 RAD51CO43502 376 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 CYP3A4P08684 503 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 EMC10Q5UCC4 262 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 SYDE2Q5VT97 1194 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 SCFD2Q8WU76 684 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 SIX2Q9NPC8 291 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 KCNQ5Q9NR82 932 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa30.59■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 NOP2P46087 812 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 STRIP1Q5VSL9 837 aa30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 TEX2Q8IWB9 1127 aa30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 BHMT2Q9H2M3 363 aa30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 GFPT2O94808 682 aa30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 GCNT3O95395 438 aa30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 CUL1Q13616 776 aa30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 EFCAB13Q8IY85 973 aa30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 BCAS4Q8TDM0 211 aa30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 ISCUQ9H1K1 167 aa30.58■■■□□ 2.49
UBP1-201ENST00000283628 SCN9AQ15858 1988 aa30.57■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 ZNF233A6NK53 670 aa30.57■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 FAM196BA6NMK8 535 aa30.57■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 EBAG9O00559 213 aa30.57■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 TCP10Q12799 353 aa30.57■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 NFIL3Q16649 462 aa30.57■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
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UBP1-201ENST00000283628 PPM1EQ8WY54 764 aa30.57■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 PIK3R5Q8WYR1 880 aa30.57■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 GCNT4Q9P109 453 aa30.57■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 FAM198AQ9UFP1 575 aa30.57■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 ECE2O60344 883 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 KRT14P02533 472 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 FERP16591 822 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 USH1GQ495M9 461 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 DACT2Q5SW24 774 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 KDM7AQ6ZMT4 941 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 SLFN11Q7Z7L1 901 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 RUSC1Q9BVN2 902 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 RSPH10B2B2RC85 870 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 H2AFZP0C0S5 128 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 RSPH10BP0C881 870 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 NPEPPSP55786 919 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 H2AFVQ71UI9 128 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 SYCE1Q8N0S2 351 aa30.56■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
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UBP1-201ENST00000283628 GUCY2FP51841 1108 aa30.55■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 BTNL9Q6UXG8 535 aa30.55■■■□□ 2.48
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UBP1-201ENST00000283628 CCDC188H7C350 402 aa30.54■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 CYP4A11Q02928 519 aa30.54■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 IKQ13123 557 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 ABCB5Q2M3G0 1257 aa30.54■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 BORCS6Q96GS4 357 aa30.54■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 CEP104O60308 925 aa30.54■■■□□ 2.48
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
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