RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa13.75□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 APOL5Q9BWW9 433 aa13.75□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 MFSD1Q9H3U5 465 aa13.75□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa13.75□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 KIAA1671Q9BY89 1806 aa13.75□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 BRD1O95696 1058 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 LAG3P18627 525 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 ITIH3Q06033 890 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 MTMR1Q13613 665 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 PLPP4Q5VZY2 271 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 LLGL2Q6P1M3 1020 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 FRMD5Q7Z6J6 570 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 ADSSL1Q8N142 457 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 CASP10Q92851 521 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 ZBTB10Q96DT7 871 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 TCF25Q9BQ70 676 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 TMX1Q9H3N1 280 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 MYO10Q9HD67 2058 aa13.74□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 MYO15AQ9UKN7 3530 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 MEIS2O14770 477 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 GPR182O15218 404 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 CLCN5P51795 746 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 PLCB3Q01970 1234 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 KRT17Q04695 432 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 SART3Q15020 963 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 CYB5R4Q7L1T6 521 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 TMC7Q7Z402 723 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 PIBF1Q8WXW3 757 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 ADAM2Q99965 735 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 ADAM7Q9H2U9 754 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 RGS18Q9NS28 235 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 LAMA4Q16363 1823 aa13.73□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 RPS6KA5O75582 802 aa13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 ITGB5P18084 799 aa13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 PPM1AP35813 382 aa13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 MTHFRP42898 656 aa13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 APOBRQ0VD83 1088 aa13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 TROAPQ12815 778 aa13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 TMEM266Q2M3C6 531 aa13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 CATIPQ7Z7H3 387 aa13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 ERVK-5Q9HDB9 667 aa13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 PKD2L1Q9P0L9 805 aa13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 GINS2Q9Y248 185 aa13.72□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 HIDE1A8MVS5 230 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 C2CD4DB7Z1M9 353 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 C9IYK1 514 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 MGEA5O60502 916 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 STAT5BP51692 787 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 WTAPQ15007 396 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 PLCB4Q15147 1175 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 MTHFD1LQ6UB35 978 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 LNPKQ9C0E8 428 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 CWH43Q9H720 699 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 PSTPIP2Q9H939 334 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 JADE2Q9NQC1 790 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 TMEM161AQ9NX61 479 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 SLC9A2Q9UBY0 812 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SPC25-201ENST00000282074 HOXA2O43364 376 aa13.71□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 KLRC1P26715 233 aa13.71□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 PDE4AP27815 886 aa13.71□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 SLC26A2P50443 739 aa13.71□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa13.71□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa13.71□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 PHF12Q96QT6 1004 aa13.71□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 PCYT2Q99447 389 aa13.71□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 TMEM117Q9H0C3 514 aa13.71□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 POMKQ9H5K3 350 aa13.71□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.71□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 SPDYE3A6NKU9 549 aa13.7□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 FGFR1P11362 822 aa13.7□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 SMARCA1P28370 1054 aa13.7□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 KIF5BP33176 963 aa13.7□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 FAM189BP81408 668 aa13.7□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 ATAT1Q5SQI0 421 aa13.7□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 KCNT2Q6UVM3 1135 aa13.7□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 FLCNQ8NFG4 579 aa13.7□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SPC25-201ENST00000282074 ZNF558Q96NG5 402 aa13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms