RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 UIMC1Q96RL1 719 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 VEZTQ9HBM0 779 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CYP11B2P19099 503 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 DR1Q01658 176 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 KCTD16Q68DU8 428 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 NLRX1Q86UT6 975 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TIPINQ9BVW5 301 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 M0R2N6 131 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GAS8O95995 478 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 BPIFB4P59827 614 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 C3orf20Q8ND61 904 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 DPH5Q9H2P9 285 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.6□□□□□ -0.87
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HERC3-201ENST00000264345 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 F5H6K3 240 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SMIM22K7EJ46 135 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 KLRC3Q07444 240 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 DRP2Q13474 957 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 EPHA7Q15375 998 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 HYIQ5T013 277 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 LRRC31Q6UY01 552 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 P3H4Q92791 437 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CHD4Q14839 1912 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ENTPD3O75355 529 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 KRT5P13647 590 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 STAT3P40763 770 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CREG2Q8IUH2 290 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ACTRT1Q8TDG2 376 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 FNBP1Q96RU3 617 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CSRNP1Q96S65 589 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 FMO2Q99518 471 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 REEP2Q9BRK0 252 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TTYH3Q9C0H2 523 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GLI3P10071 1580 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 AKAP11Q9UKA4 1901 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GDF11O95390 407 aa9.59□□□□□ -0.87
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HERC3-201ENST00000264345 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 DNAI2Q9GZS0 605 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 FEM1BQ9UK73 627 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SLIT2O94813 1529 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 P4HA2O15460 535 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 STRIP1Q5VSL9 837 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 UBXN6Q9BZV1 441 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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HERC3-201ENST00000264345 TMEM253P0C7T8 217 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ADCY2Q08462 1091 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 HOOK2Q96ED9 719 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 EPN3Q9H201 632 aa9.58□□□□□ -0.88
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HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PRG0 241 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD62A6NC57 917 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 CYP3A7P24462 503 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 CHRNA3P32297 505 aa9.58□□□□□ -0.88
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HERC3-201ENST00000264345 CORO7P57737 925 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 STRN3Q13033 797 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 GSTA5Q7RTV2 222 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 DYDC2Q96IM9 177 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 NT5C1BQ96P26 610 aa9.58□□□□□ -0.88
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HERC3-201ENST00000264345 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 FGGP02679 453 aa9.58□□□□□ -0.88
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