RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 SLC4A1P02730 911 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-201ENST00000261169 ZNF18P17022 549 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-201ENST00000261169 EPHB4P54760 987 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-201ENST00000261169 HMGCS2P54868 508 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-201ENST00000261169 ITKQ08881 620 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-201ENST00000261169 HADHQ16836 314 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
LMO3-201ENST00000261169 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
LMO3-201ENST00000261169 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
LMO3-201ENST00000261169 FYB2Q5VWT5 728 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-201ENST00000261169 MCTP2Q6DN12 878 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-201ENST00000261169 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
LMO3-201ENST00000261169 ZWILCHQ9H900 591 aa5.96□□□□□ -1.45
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LMO3-201ENST00000261169 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 CCDC14Q49A88 953 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 OR6B2Q6IFH4 312 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 LDHDQ86WU2 507 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 TRIM50Q86XT4 487 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 RFX6Q8HWS3 928 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 TC2NQ8N9U0 490 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 FMO2Q99518 471 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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LMO3-201ENST00000261169 EHD2Q9NZN4 543 aa5.96□□□□□ -1.46
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LMO3-201ENST00000261169 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 PASKQ96RG2 1323 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 ZNF233A6NK53 670 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 M0QZ92 97 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 PIK3R2O00459 728 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 MYL1P05976 194 aa5.96□□□□□ -1.46
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LMO3-201ENST00000261169 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 SLC9A1P19634 815 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 ZNF543Q08ER8 600 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 PSMD2Q13200 908 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 PPP2R5AQ15172 486 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 E2F4Q16254 413 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 EPC2Q52LR7 807 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 DNAJC24Q6P3W2 148 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 TMEM270Q6UE05 265 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 C4orf50Q6ZRC1 276 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 XXYLT1Q8NBI6 393 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 NLRP7Q8WX94 980 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 PPM1EQ8WY54 764 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 MSTO1Q9BUK6 570 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 PLA2G12BQ9BX93 195 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.96□□□□□ -1.46
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LMO3-201ENST00000261169 FRMD3A2A2Y4 597 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 TFRCP02786 760 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 KRT1P04264 644 aa5.95□□□□□ -1.46
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LMO3-201ENST00000261169 ATXN8OSP0DMR3 200 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 PDHBP11177 359 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 P4HA1P13674 534 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 GGCXP38435 758 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 NPEPPSP55786 919 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 ARPP19P56211 112 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 TMED2Q15363 201 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 TERF2Q15554 542 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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LMO3-201ENST00000261169 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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LMO3-201ENST00000261169 TMEM39BQ9GZU3 492 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
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LMO3-201ENST00000261169 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 AMACRQ9UHK6 382 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 DUSP10Q9Y6W6 482 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 ARHGAP42A6NI28 874 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA8KD6RF30 607 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 CD44P16070 742 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 ARHGAP25P42331 645 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 ERFP50548 548 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 SLC27A3Q5K4L6 730 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-201ENST00000261169 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa5.95□□□□□ -1.46
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