RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256474.2

VHL-201, Transcript of von Hippel-Lindau tumor suppressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VHL, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHL-201ENST00000256474 GLG1Q92896 1179 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TISP43B9A030 160 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 BBOX1O75936 387 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 IL1R1P14778 569 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 GALCP54803 685 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 PLTPP55058 493 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 MDM1Q8TC05 714 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 IQCDQ96DY2 449 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TNFAIP3P21580 790 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 DDR1Q08345 913 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ODR4Q5SWX8 454 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ACP6Q9NPH0 428 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 NR2E1Q9Y466 385 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 CENPFP49454 3210 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 EVI5O60447 810 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 HSD17B3P37058 310 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 SP4Q02446 784 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 BANK1Q8NDB2 785 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 SNX24Q9Y343 169 aa14.71□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 PJA2O43164 708 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 ADCY1Q08828 1119 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 GANQ9H2C0 597 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 AMFRQ9UKV5 643 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 MSH4O15457 936 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 NDUFB10O96000 172 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 PRLRP16471 622 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 ECE1P42892 770 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 IFNAR2P48551 515 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 CPXCR1Q8N123 301 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 SLC12A3P55017 1021 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.7□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 MEIS2O14770 477 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 VPS41P49754 854 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 MESDQ14696 234 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 MGARPQ8TDB4 240 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 VEZTQ9HBM0 779 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 GRIN2DO15399 1336 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 GAS7O60861 476 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 GJC1P36383 396 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 GABPAQ06546 454 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 NSMFQ6X4W1 530 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 FAM84AQ96KN4 292 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.061e-25■■■■■ 39.5
VHL-201ENST00000256474 KAT2BQ92831 832 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 DNAJC18Q9H819 358 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.69□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.68□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 PALB2Q86YC2 1186 aa14.68□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.68□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.68□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.68□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 TMEM150BA6NC51 233 aa14.68□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.68□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 PPP1R37O75864 691 aa14.68□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 LCA5LO95447 670 aa14.68□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 CCDC38Q502W7 563 aa14.68□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms