RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 ALS2Q96Q42 1657 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 GNAZP19086 355 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 KLRC3Q07444 240 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 GALNT15Q8N3T1 639 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 FBXO25Q8TCJ0 367 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 GLG1Q92896 1179 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 TSG101Q99816 390 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 C2CD2Q9Y426 696 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 LAMB3Q13751 1172 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 NUGGCQ68CJ6 796 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 RMDN2Q96LZ7 410 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 SEMA4AQ9H3S1 761 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 SNX24Q9Y343 169 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 LRRC42Q9Y546 428 aa23.05■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 TRAF5O00463 557 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 FLOT1O75955 427 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 DR1Q01658 176 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 LETM2Q2VYF4 491 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 C6orf118Q5T5N4 469 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 DUPD1Q68J44 220 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD27Q96NW4 1050 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 RPTORQ8N122 1335 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 LMNTD2Q8IXW0 634 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 ERP44Q9BS26 406 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 MLXIPLQ9NP71 852 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.04■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 PYGLP06737 847 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 RAD23BP54727 409 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 ADAM9Q13443 819 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 FBF1Q8TES7 1133 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 ABCF2Q9UG63 623 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 NAGPAQ9UK23 515 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 WFS1O76024 890 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 NPTXRO95502 500 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 ZDHHC24Q6UX98 284 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 SPATA21Q7Z572 469 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 CALML4Q96GE6 196 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 PLCD4Q9BRC7 762 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23.03■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 A0A1B0GVG6 124 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 GJB6O95452 261 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 GBP1P32455 592 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 NT5DC3Q86UY8 548 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 GANQ9H2C0 597 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 ASB3Q9Y575 518 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 STRCQ7RTU9 1775 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 FGFR4P22455 802 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 NLRP10Q86W26 655 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-201ENST00000234111 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 ACTN1P12814 892 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 PTENP60484 403 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 GRB10Q13322 594 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 SLFN11Q7Z7L1 901 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 CCNB1P14635 433 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 ATP6V1C1P21283 382 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 AUHQ13825 339 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 TMEM154Q6P9G4 183 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 EXOC3L1Q86VI1 746 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ODC1-201ENST00000234111 EPAS1Q99814 870 aa23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms