RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa19■□□□□ 0.63
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SPCS1-201ENST00000233025 VAT1LQ9HCJ6 419 aa19■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 FBXL21Q9UKT6 434 aa19■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf71A6NGG8 1288 aa18.99■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 FIBPO43427 364 aa18.99■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
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SPCS1-201ENST00000233025 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.99■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA0319Q5VV43 1072 aa18.99■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.99■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 FEZF2Q8TBJ5 459 aa18.99■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 MTMR8Q96EF0 704 aa18.99■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa18.99■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.99■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa18.99■□□□□ 0.63
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SPCS1-201ENST00000233025 STAM2O75886 525 aa18.98■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 SP9P0CG40 484 aa18.98■□□□□ 0.63
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SPCS1-201ENST00000233025 HAND2P61296 217 aa18.98■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 KANK3Q6NY19 840 aa18.98■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 FCHSD1Q86WN1 690 aa18.98■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 SENP7Q9BQF6 1050 aa18.98■□□□□ 0.63
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SPCS1-201ENST00000233025 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.97■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 ATAT1Q5SQI0 421 aa18.97■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 TMC7Q7Z402 723 aa18.97■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 KCNK12Q9HB15 430 aa18.97■□□□□ 0.63
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SPCS1-201ENST00000233025 C9IYK1 514 aa18.96■□□□□ 0.63
SPCS1-201ENST00000233025 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
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SPCS1-201ENST00000233025 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.96■□□□□ 0.63
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SPCS1-201ENST00000233025 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 WNT16Q9UBV4 365 aa18.95■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa18.94■□□□□ 0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 ZZEF1O43149 2961 aa18.93■□□□□ 0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 DCDC2BA2VCK2 349 aa18.92■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 KINO60870 393 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 EPCAMP16422 314 aa18.92■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 KRT17Q04695 432 aa18.92■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 GLG1Q92896 1179 aa18.92■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.92■□□□□ 0.62
SPCS1-201ENST00000233025 HELLSQ9NRZ9 838 aa18.92■□□□□ 0.62
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