RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	MAS2	P11914	482 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	HEM15	P16622	393 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	CDC42	P19073	191 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
RRN11	YML043C	BEM1	P29366	551 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PAH1	P32567	862 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ECT1	P33412	323 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	TOD6	P34219	525 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MRPL15	P36523	253 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	AVT5	P38176	459 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	IST2	P38250	946 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SHG1	P38337	142 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YHK8	P38776	514 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	FAA2	P39518	744 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	UIP3	P39547	235 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	NPP2	P39997	493 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	FAU1	P40099	211 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PFA3	P42836	336 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SAD1	P43589	448 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PMT4	P46971	762 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ALY2	P47029	1046 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MTC3	P53077	123 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YGL204C	P53089	101 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	LCL3	P53153	274 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RPN14	P53196	417 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RRN9	P53437	365 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	KTR6	P54070	446 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	NHX1	Q04121	633 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SMA2	Q04658	369 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YPS7	Q06325	596 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	VAM3	Q12241	283 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RRD2	Q12461	358 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PCD1	Q12524	340 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MTR10	Q99189	972 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ISN1	Q99312	450 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	FKS3	Q04952	1785 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	BI2	P03873	423 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RAD7	P06779	565 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	HOP1	P20050	605 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	POF1	P25576	258 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ARO7	P32178	256 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	NGG1	P32494	702 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	FRE1	P32791	686 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	LST4	P34239	828 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RRT2	P38332	387 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	BIG1	P38813	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	FMO1	P38866	432 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RBG1	P39729	369 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	EFM3	P47163	339 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	TAD1	P53065	400 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	GET1	P53192	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YNR061C	P53747	219 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	TEP1	P53916	434 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	CAC2	Q04199	468 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MDM30	Q05930	598 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YPR127W	Q06494	345 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RRT8	Q08219	342 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MDM32	Q12171	622 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YOP1	Q12402	180 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MOT1	P32333	1867 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	GAL4	P04386	881 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	COS2	P0CX12	379 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	COS3	P0CX13	379 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	CAP2	P13517	287 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	EMC1	P25574	760 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	MRPL9	P31334	269 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	ATP11	P32453	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SPC34	P36131	295 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	ECM8	P38246	354 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRN11	YML043C	HSL7	P38274	827 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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