RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 RTN2O75298 545 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 PPP2R5AQ15172 486 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CAMTA2O94983 1202 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TSPY3P0CV98 308 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TSPY8P0CW00 308 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CHN1P15882 459 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CCDC197Q8NCU1 140 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 C6orf50Q9HD87 102 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.36■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 NEBLO76041 1014 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TCP11Q8WWU5 503 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SEC14L1Q92503 715 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CUL5Q93034 780 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 NAGPAQ9UK23 515 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SLC12A4Q9UP95 1085 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SLC9A1P19634 815 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 P3H4Q92791 437 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 MMEP08473 750 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 COPB2P35606 906 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 NAA25Q14CX7 972 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 FAM170AA1A519 330 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 PSMD2Q13200 908 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 PEX26Q7Z412 305 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 PIGSQ96S52 555 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CCDC188H7C350 402 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 MYO1EQ12965 1108 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 PANK4Q9NVE7 773 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 PPFIA2O75334 1257 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 GNA11P29992 359 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 KCNH2Q12809 1159 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 LRRC34Q8IZ02 419 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 UIMC1Q96RL1 719 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SWAP70Q9UH65 585 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-222ENST00000639501 SMIM23A6NLE4 172 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 CLTAP09496 248 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 PARP10Q53GL7 1025 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 CCDC63Q8NA47 563 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 CEP63Q96MT8 703 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 FMO2Q99518 471 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 TAX1BP1Q86VP1 789 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 A0A1B0GUA9 196 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 EPS15P42566 896 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 SOGA3Q5TF21 947 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 KRT79Q5XKE5 535 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 PIGWQ7Z7B1 504 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-222ENST00000639501 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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